Способ ингибирования экспрессии гена в растительной ткани- мишени
Изобретение относится к генной инженерии и может быть использовано в селекции растений. Способ ингибирования экспрессии гена в растительной ткани, из которой может быть выращено целое растение, заключается в трансформации клеток растения генной конструкцией, содержащей тканеспецифичный или специфичный промотор, функционирующий в ткани-мишени, и деструктивный ген, кодирующий белок, ингибирующий жизненно важную функцию клеток, например клеточное дыхание. Ингибирование клеточного дыхания приводит к гибели клеток, что обеспечивает получение мужских стерильных растений. Деструктивный ген выбирают из группы, состоящей из гена T-urfl3, генов, кодирующих - и
-тубулин, и короткой смысловой конструкции с адениннуклеотидным транслокатором (ANT) внутренней митохондриальной мембраны. 6 з.п.ф-лы, 14 ил. 5 табл.
Изобретение относится к способу получения стерильных мужских растений путем использования гена, который экспрессируется в растениях и существенно ингибирует клеточную функцию, тем самым полностью нарушая экспрессию избранного признака растения.
Наша Международная Патентная Заявка N WO 90/08831 описывает и формулирует нарушение дыхания использованием различных деструктивных генов, которые мы относим также к так называемым "генам, инактивирующим опыление". Способность таких инактивирующих генов функционировать данным образом варьирует и поэтому существует необходимость совершенствовать генные последовательности так, чтобы можно было осуществлять надлежащий отбор для конкретного использования. Цель настоящего изобретения заключается в создании генов для применения в ингибировании генной экспрессии. В соответствии с настоящим изобретением разработан способ ингибирования генной экспрессии в растительной ткани-мишени, включающий стабильную трансформацию вида растительной клетки, из которой можно регенерировать целое растение с помощью генного конструкта, несущего тканеспецифичный или специфичный для развития промотор, который действует в данных клетках данной растительной ткани-мишени, и деструктивный ген, кодирующий белок, который обладает способностью при экспрессии ингибировать дыхание в этих клетках этой указанной ткани-мишени, приводящий к гибели эти клетки, отличающийся тем, что этот указанный деструктивный ген выбран из группы, состоящей из гена T-urf13, генов, кодирующих









фигура 10 показывает последовательность промотора MFS14 (SEQ ID NO 8) с нижеследующими характеристиками:
позиция 2198 CCT"A"CAA-начало транскрипции (консенсус CCT"A"CAA)
позиция 2167 ATCCATT (возможный мотив TATA-бокса)
позиция 2141 (возможный мотив CAAT-бокса)
позиция 2233 CAC"A"CAG-начала cdna
позиция 2295 GCAACAATGGCG-начало трансляции (консенсус TAAACAATGGCT);
фигура 11 представляет собой карту вектора RMS11;
фигура 12 представляет собой карту вектора pMANT3;
фигура 13 иллюстрирует соответствующие конструкции векторов для трансформированной линии клеток кукурузы;
фигура 14 представляет собой диаграмму, показывающую изменчивость количества трансформантов, полученных в разных экспериментах. Далее настоящее изобретение иллюстрируется нижеследующими примерами. Пример 1
Конструирование вектора RMS17, трансформирующего кукурузу
Мы применили соответствующую PCR для амплификации гена T-urf13 из кукурузы cms-T (линия RW33:TMS) и соответствующую митохондриальную мишенную последовательность, pre-


(5'ATCGGTACCGCCATGGCTTCTCGGAGGCTTCTCGCCT-3', SEQ ID NO 6) и PREB-R (5'ATCGGATCCCGCTGCGGAGGTAGCGTA-3', SEQ ID NO 7), созданных с использованием информационной последовательности, разработанной Boutry с соавт. (1987, Nature, 328, 341). Условия данной PCR были такими же, какие описаны выше, за тем исключением, что температура отжига была снижена до 60oC. Для содействия последующему клонированию создали такие PREB-IB и PREB-2R, чтобы они интродуцировали уникальные сайты рестрикции Kpnl и BamRI соответственно на 5' и 3' концах амплифицированного фрагмента. Соответствующая позиция этих праймеров относительно данного гена ATP представлена на фигуре 5. После амплификации этот pre-B-PCR-фрагмент обрабатывали с помощью Kpnl и BamHI, чтобы получить липкие концы и клонировать в соответствующие сайты вектора pUC18 для создания плазмиды pPB1. Затем продукт PCR TURF-13 обрабатывали с помощью BamhI и Xbal и клонировали в соответствующие сайты в pPB1, чтобы создать плазмиду pPB2. В pPB2 pre-





Трансформация BMS-клеток кукурузы с помощью RMS17
Целью этого эксперимента было показать, что экспрессия генного конструкта pre

Получение нитевидных монокристаллов карбида кремния
Высушенные нитевидные монокристаллы всегда находились под рукой в испаряемой камере, чтобы предотвратить вдыхание и повреждение легких. Эти нитевидные монокристаллы могут быть канцерогенными, поскольку они обладают свойствами, подобными асбесту. Нитевидные монокристаллы Silar SC-9 были разработаны Advanced Composite Material Corporation Greer, South Carolina, США. Стерильные суспензии нитевидных монокристаллов готовили заблаговременно следующим образом. Примерно 50 мг нитевидных монокристаллов помещали в предварительно взвешенную 1,5 мл пробирку Эппендорфа, которую закрывали колпачком и вновь взвешивали для определения веса нитей. Колпачок пробирки прокалывали иглой шприца и покрывали двойным слоем алюминиевой фольги. Эту пробирку автоклавировали (121oC, 103,4 kPa, 15 psi) в течение 20 минут и высушивали. Свежие суспензии нитевидных монокристаллов получали для каждого эксперимента, поскольку сообщалось, что уровень трансформации ДНК при использовании свежих суспензий был выше, чем при использовании старых суспензий. 5% (вес/объем) суспензию нитевидных кристаллов готовили с использованием деионизированной воды. Непосредственно перед употреблением ее встряхивали несколько секунд, чтобы суспендировать эти нитевидные монокристаллы. Трансформация ДНК в клетках
Все операции осуществляли в вентилируемом ламинарном боксе в асептических условиях. Соответствующей ДНК трансформировали соответствующие клетки, используя следующую методику. Конкретные модификации этого метода приведены в данном тексте. Суспензии клеток и нитевидных монокристаллов раскапывали, используя срезанные наконечники в пипетке Gilson. 100 мкл свежей BMS-среды (смотрите приложение 1) отмеряли в стерильную пробирку Эппендорфа. Туда же добавляли 40 мкл 5% (в/о) суспензии нитевидных монокристаллов и 25 мкл (1 мг/мл) плазмидной ДНК, и все это встряхивали с максимальной скоростью в течение 60 секунд, используя настольный аппарат для встряхивания и перемешивания (Vortex Genie 2 Scientific industries. Inc). Сразу же после встряхивания добавляли 500 мкл соответствующей клеточной суспензии, т.е. 250 мкл осажденных клеток. Эту пробирку Эппендорфа закрывали колпачком и встряхивали с максимальной скоростью в течение 60 секунд в вертикальном положении. Эту же процедуру применяли при трансформации других линий клеток. В этот эксперимент включили три контроля. Двумя позитивными контрольными векторами были pPG3, которые содержали только селекционную кассету PAT, и RMS15, который идентичен RMS17, за тем исключением, что ген T-urf13 замещен на митохондриальный неприсоединенный белковый ген, UCP, который не влияет на культивирование BMS-клеток. Данная pre-


Конструирование вектора RMS11, трансформирующего кукурузу
RMS11 представляет собой трансформирующий вектор, в котором экспрессия слитого гена pre-



Трансформация клеток кукурузы с помощью RMS11 путем бомбардировки частицами для создания стабильно трансформированных мужских стерильных растений
Трансформирующий вектор кукурузы, RMS11, применяли для трансформации регенерируемых клеточных культур кукурузы путем бомбардировки частицами. Культивируемый материал
Рыхлый эмбриональный каллус типа II, инициировали из неполовозрелых зиготических зародышей, вырезанных из оранжерейных или из коллекционных выращенных растений A188 на 10-12 день после опыления пыльцой от природного B73. Используемая среда для инициации и выращивания каллуса создана на основе среды N 6, модифицированной Armstrong и Green. В частности, среда содержала 6 мМ L-пролина, 2% (в/о) сахарозы, 2 мг/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты (2,4-D) и 3% (в/о) Gelrite (Trade mark, Caroline Biological Supply) при pH 6,0. Каллус выращивали в течение 4-4 недель перед инициацией культивирования суспензии. Суспензионные культуры инициировали в базовой жидкой MS-среде, содержащей 100 мг/л миоинозита, 2 мг/л 2,4-D, 2 мг/л 1-нафтилуксусной кислоты (NAA), 6 мМ пролина, 200 мг/л гидролизата казеина (Difco Laboratories), 35% (в/о) сахарозы и 5% (о/о) кокосовой воды (Difco Laboratories) при pH 6,0. Клеточные суспензии выдерживали в этой среде в 125 мл склянках Эрленмейера при 28oC в темноте на круговой качалке при 125 об/мин. Суспензию субкультивировали каждые 3,5 дня путем добавления 3 мл объема осажденных клеток в 10 мл культуральной среды, доведенной до 20 мл свежей культуральной средой. Эти суспензионные культуры имели обычно возраст от 6 месяцев до 1 года ко времени бомбардировки. Для некоторых трансформаций использовали суспензионные культуры, оживленные после криоконсервации. Бомбардировка микропулями
Клеточные суспензии процеживали через 1,0 мм, а затем - 0,5 мм сито. Сконцентрированные до объема 0,2 мл эти клетки, которые пропускали через сита, суспендировали затем в 5 мл суспензионной среды и равномерно распределяли на диске фильтровальной бумаги Whatman N 4 путем вакуумной фильтрации, используя 4,7 см держатель для микроанализа. На вольфрамовые частицы осаждали сверхспирализованную плазмидную ДНК и бомбардировали, применяя аппарат DuPont PDS-1000 Biolistics (Trade Mark) фактически так, как написано в инструкции изготовителей. Пластинки-мишени бомбардировали однократно. Отбор трансформантов и регенерация растений
После бомбардировки каждый фильтровальный диск (с клетками) переносили в базовую N6-среду, содержащую 100 мг/л миоинозита, 2 мг/л 2,4-D, 3% (в/о) сахарозы и 0,3% (в/о) Gelrite при pH 6,0. Для селекции с использованием NPTII-гена эту среду дополняли 200 мг/л сульфата канамицина. Эти фильтровальные диски переносили в свежую среду, содержащую данный селективный агент, через семь, а затем вновь через 14 дней. Полученную суспензию делили на две равные аликвоты и каждую равномерно распределяли по отвержденной пластинчатой 20 мл среде, содержащей данный селективный агент и 3% (в/о) Gelrite в 100 x 20 мм чашках Петри. Спустя 2-5 недель, быстрорастущий, предположительно трансформированный каллус удаляли и переносили на поверхность свежей селекционной среды. Растения регенерировали в результате перенесения ткани в базовую MS-среду, содержащую 1 г/л миоинозита, 1 мг/л NAA, 6% (в/о) сахарозы и 3% (в/о) Gelrite при pH 6,0. Через 2-3 недели эту ткань переносили в MS-среду, содержащую 0,25 мг/л NAA и 3% (в/о) сахарозы, и помещали на свет, где наблюдали прорастание зародышей. Затем растения росли на MS-среде половинной концентрации, содержащей 500 мг/л миоинозита, 3% (в/о) сахарозы и 0,3% Gelrite при pH 6,0, приблизительно в течение 1-2 недель до переноса в теплицу. После переноса в теплицу растения в рамках каждого независимо трансформированного клона тестировали на наличие генного конструкта MFS14/pre-B/T-urf13 с применением PCR. ДНК экстрагировали из небольших образцов листьев, применяя методику, описанную у Edwards с соавт. (1991, Nucleic Acids Research, 19, 1349), и использовали в этой PCR с помощью соответствующих праймеров, 14-SA (5'-AGACGCTGAGCTCAAGGACGTGA-3' SEQ ID NO 9) и turf-2R (смотрите пример 1, касающийся последовательности этого праймера). Оценивали способность к цветению этих растений в рамках каждого независимо трансформированного клона в условиях теплицы, применяя визуальную шкалу, созданную для CMS-линий и описанную в таблице 2. Растения с оценкой 4 и ниже являются функционально стерильными. Отмеченные стерильностью растения, собранные по каждому из PCR-независимых клонов, показаны в таблице 3 и сравнены с линией кукурузы, которую получили путем бомбардировки с помощью RMS11, но которая является PCR-негативной по генному конструкту MFS14/pre-B/T-urf13. Стерильные растения подвергали обратному опылению пыльцой фертильных, нетрансгенных BE70-растений. Потомство от семян, полученных от одного из этих опылений (клон YK23, растение 5 x BE70), вырастили в теплице в зацветшее растение. Наличие генного конструкта MFS14/pre-B/T-urf13, определенного с помощью PCR и PAT-теста (последним определяли, действительно ли селективный маркер присутствует в трансформационном процессе), и подсчет фертильных растений представлены в таблице 4. Растения, которые оказались PCR-негативные, удаляли из тепличного посева до цветения. Растения 1 и 2, обладающие неубедительным PCR-тестом, держали до цветения. Растение 12 сохраняли в качестве контроля. Как видно в таблице 4, 6 из выращенных растений оказались стерильными и эта стерильность коррелировала с наличием трансгена, как установлено либо с помощью PCR, либо PAT-тестированием. Это согласуется с наличием единственного трансгенного локуса, наделяющего стерильностью. Пример 5
Конструирование вектора pRMS-23, трансформирующего кукурузу
Мы проверили, действительно ли экспрессия короткосмыслового конструкта из адениннуклеотидного транслокаторного (ANT) гена кукурузы будет приводить к дефекту в росте данных клеток кукурузы. Выделили фрагмент кукурузного ANT, используя метод PCR и праймеры, созданные из последовательности указанного кукурузного гена, опубликованные у Bathgate с соавт. (1989, Eur. J. Biochem. , 83, 303-310). Этот фрагмент этого ANT амплифицировали методом PCR, используя праймеры MANT-1(5'-ATGCCCGGGCTTGCAATGTCTGTTAGCGGTGGCATCA-3', SEQ ID NO 11). Условия PCR были - 35 циклов денатурации при 94oC в течение 0,8 мин, отжиг при 65oC в течение 1 мин и удлинение при 72oC в течение 2,5 минут. Чтобы содействовать последующему клонированию, создали PCR-праймеры так, чтобы они интродуцировали уникальные SmaI-рестрикционные сайты по 5' и 3' концам данного гена. Эта последовательность кукурузного гена ANT была опубликована в Eur. J. Biochem. (1989) 183, 303-310. Эта праймерная последовательность MANT-1 находится в начале кодирующей последовательности данного гена, а праймерная последовательность MANT-2R находится вблизи окончания этого гена. После PCR, в которой получили фрагмент ДНК ожидаемого размера 1050 т.п. н. , эту ДНК обрабатывали с помощью Smal и субклонировали в этот Smal-саит pUC18, чтобы получить pMANT1. Затем сигнальную nos 3'-последовательность полиаденилирования интродуцировали 3'-концом с геном ANT в виде SacI-EcoRI-фрагмента в соответствующие сайты в pMANT1, чтобы получить pMANT2. Фрагмент Hindlll-BamHI, несущий 35S-промотор CaMV и интрон ADH 1 из pCaMVI1N (фигура 5), интродуцировали в корреспондирующие сайты pMANT2, чтобы получить pMANT3. pRMS-23 (фигура 12) укомплектовали путем интродуцирования селективной in vitro кассеты PAT из pIE109 (фигура 7) в уникальный EcoRI-сайт pMANT3. Пример 6
Трансформация клеток кукурузы BMS с помощью pRMS-23
Цель этого эксперимента состояла в том, чтобы показать, что экспрессия pRMS-23 в культивируемых клетках кукурузы BMS приводит к снижению клеточной жизнеспособности, которую измерили путем образования трансгенного каллуса после трансформации в двух различных экспериментах. Векторные ДНК интродуцировали в культивируемые клетки BMS, используя методику трансформирования волокном карбида кремния, которая описана в примере 2. После трансформации с помощью pRMS23 определяли в среднем количество образованного каллуса относительно позитивного контроля pPG3, который содержал только in vitro селективную кассету (таблица 5). Эти данные свидетельствуют, что экспрессия короткого смыслового адениннуклеотидного транслокаторного гена приводит к существенному уменьшению образующегося трансгенного каллуса. Пример 7
Конструирование трансформирующих векторов кукурузы, pTBR и pTBS
Мы проверили, может ли нерегулируемая экспрессия генов




Трансформация клеток кукурузы BMS с помощью pTBR и pTBS
Цель этого эксперимента заключалась в том, чтобы показать, что экспрессия pTBR и pTBS в культивируемых клетках кукурузы BMS приводит к снижению жизнеспособности клеток, что измерили после трансформации по образованию трансгенного каллуса. Векторные ДНК интродуцировали в культивируемые BMS-клетки методом трансформации с использованием волокна карбида кремния, как описано в примере 2. После трансформации с помощью pTBR и pTBS определяли средние значения образованного трансгенного каллуса относительно позитивного контроля pPG3, который содержит лишь полученную in vitro селективную кассету (фигура 14). Эти данные свидетельствуют, что нерегулируемая экспрессия гена

Формула изобретения


РИСУНКИ
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3, Рисунок 4, Рисунок 5, Рисунок 6, Рисунок 7, Рисунок 8, Рисунок 9, Рисунок 10, Рисунок 11, Рисунок 12, Рисунок 13, Рисунок 14, Рисунок 15, Рисунок 16, Рисунок 17, Рисунок 18, Рисунок 19, Рисунок 20, Рисунок 21, Рисунок 22, Рисунок 23, Рисунок 24, Рисунок 25, Рисунок 26, Рисунок 27, Рисунок 28