Н- и l-цепи моноклонального антитела рм1 (монат) к рецептору il-6r человека и их v-области, модифицированная монат, его н- и l-цепи и их v-области, cdr- последовательности, днк-последовательности
Изобретение представляет V-область L-цепи мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R и Н-цепь V-области мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R. Также представлены модифицированные антитела к человеческим IL-6R. Представлена также ДНК-последовательность, кодирующая вышеназванные антитела или их части. Антитела к рецепторам человеческого IL-6R применимы в качестве терапевтического средства для лечения миеломы. 18 с. и 6 з.п.ф-лы., 24 ил., 11 табл.
Изобретение относится к вариабельной области (V-области) мышиных моноклональных антител к рецепторам человеческого интерлейкина-6 (IL-6R), человеческим/мышиным химерным антителам к человеческим IL-6R и измененным человеческим антителам, включающим человеческие антитела, в которых области, определяющие комплементарность (CDRS) V-области человеческих легких цепей (L-цепей) и V-области человеческих тяжелых цепей (H цепей) перенесены в CDRS мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R. Кроме того, настоящее изобретение представляет ДНК, кодирующую вышеупомянутые антитела или их части. Настоящее изобретение к тому же представляет векторы, особенно векторы экспрессии, содержащие вышеназванную ДНК, и клетки-хозяева, трансформированные или трансфицированные вышеназванным вектором. Настоящее изобретение дополнительно еще представляет способ получения химерных антител к человеческому IL-6R и способ получения измененных человеческих антител к человеческому IL-6R.
Интерлейкин-6 (IL-6) является полифункциональным цитокином, который продуцируется рядом клеток. Он регулирует иммунный ответ, реакции острой фазы и гематопоэз и может играть центральную роль в механизмах защиты организма-хозяина. Он действует на широкий ряд тканей, оказывая вызывающее рост, подавляющее рост и вызывающее дифференциацию воздействие зависимости от природы клеток-мишеней. Специфические рецепторы для IL-6 (IL-6R) экспрессируются на лимфоидных, так же как и на нелимфоидных клетках в соответствии с полифункциональными свойствами IL-6. Было высказано предположение, что ненормальная экспрессия IL-6 гена включена в патогенез многих заболеваний, особенно аутоиммунных заболеваний, мезангиального пролиферативного гломерулонефрита и плазмацитомы/миеломы (смотрите обзор Hirdno et al., Immunol. Today 11, 443-449, 1990). Наблюдается, что человеческие миеломные клетки продуцируют IL-6 и экспрессируют IL-6R. В экспериментах антитела против IL-6 подавляли in vitro рост миеломных клеток, показывая таким образом, что аутокринный регуляторный замкнутый контур управляет онкогенезом человеческих миелом (Kawano et al., Nature, 332, 83, 1988). IL-6R присутствуют на поверхности различных животных клеток и специфически связываются с IL-6, и о числе молекул IL-6R на клеточной поверхности сообщалось (Taga et al, J. Exp. Med. 196, 967, 1987). Кроме того, кДНК, кодирующая человеческий IL-6R была клонирована, и о первичной структуре IL-6R сообщалось (Yamasaki et al., Science 241, 825, 1988). Мышиные антитела высоко иммуногенны у людей и по этой причине их терапевтическое значение для людей ограничено. Полупериод присутствия мышиных антител in vitro у людей относительно короток. Кроме того, мышиные антитела невозможно применить с многократным дозированием без образования иммунного ответа, который не только препятствует ожидаемой эффективности, но также создает риск побочной аллергической реакции у пациента. Чтобы разрешить эти проблемы были разработаны методы получения очеловеченных мышиных антител. Мышиные антитела могут быть очеловечены двумя путями. Более простым методом является создание химерных антител, когда V-области происходят из первоначальных мышиных моноклональных антител и C-области происходят из подходящих человеческих антител. Получаемые в результате химерные антитела содержат целые V-области исходных мышиных антител, и можно ожидать связывания антигена с той же самой специфичностью, что и у исходных мышиных антител. Кроме того, химерные антитела имеют существенное снижение процентного содержания белковой последовательности, происходящей из нечеловеческого источника, и поэтому ожидается, что они будут менее иммуногенны, чем исходные мышиные антитела. Хотя химерные антитела, как предсказано, хорошо связываются с антигеном и менее иммуногенны, иммунный ответ на мышиные V-области может все же присутствовать (Lo Buglio et al, Proc. Natl. Acad. Scl, USA 84, 4220-4224, 1989). Второй способ очеловечивания мышиных антител более сложен, не более интенсивно снижает потенциальную иммуногенность мышиных антител. При этом методе области, определяющие комплементарность (CDRS) из V-областей мышиных антител пересаживаются в человеческие области для создания "видоизмененных" человеческих V-областей. Эти измененные человеческие V-области затем соединяются с человеческими C-областями. Единственными частями конечных измененных человеческих антител, образованными нечеловеческими протеиновыми последовательностями, являются CDRS, CDRS состоит из высоковариабельных протеиновых последовательностей. В них не обнаружено видоспецифических последовательностей. По этим причинам преобразованные человеческие антитела, несущие мышиные CDRS, не должны быть более иммуногенны, чем естественные человеческие антитела, содержащие человеческие CDRS. Как видно из вышеприведенного, предполагается, что измененные человеческие антитела будут применяться для терапевтических целей, но преобразованные человеческие антитела к человеческим IL-6R неизвестны. Более того, не существует способа получения видоизмененных человеческих антител, универсально применимого для любых конкретных антител. Поэтому, чтобы получить вполне активные видоизмененные человеческие антитела к конкретному антигену, необходимы различные способы. Даже хотя и были получены мышиные моноклональные антитела к человеческому IL-6R, т.е. PM1 и MT18 (Японская патентная заявка N 2-189420), и авторы настоящего изобретения получили мышиные моноклональные антитела к человеческому IL-6R, т.е. AUK 12-20, AUK 64-7 и AUK 146-15, авторы настоящего изобретения не знают публикаций, которые представляют создание видоизмененных человеческих антител к человеческому IL-6R. Авторы настоящего изобретения обнаружили также, что когда мышиные моноклональные антитела к человеческим IL-6R вводили безволосым мышам, которым трансплантировались миеломные клетки человеческой линии, рост опухоли заметно подавлялся. Это дает основание полагать, что антитела к рецепторам человеческого IL-6 применимы в качестве терапевтического средства для лечения миеломы. Поэтому настоящее изобретение направлено на получение менее иммуногенных антител к человеческим IL-6R. Соответственно настоящее изобретение представляет видоизмененные человеческие антитела к человеческим IL-6R. Настоящее изобретение также представляет часть видоизмененного человеческого антитела, так же как и системы экспрессии для продукции видоизмененных человеческих антител и их частей и химерные антитела. Более конкретно, настоящее изобретение представляет V-область L-цепи мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R и H-цепь V-области мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R. Настоящее изобретение также представляет химерные антитела к человеческим IL-6R, включающие: (1) L-цепь, содержащую человеческую C-область L-цепи и V-область L-цепи мышиного моноклонального антитела к IL-6R, и (2) H-цепь, содержащую человеческую C-область H-цепи и V-область H-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R. Настоящее изобретение также представляет CDR V-области L-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R, и CDR V-области H-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R. Настоящее изобретение, сверх того, представляет видоизмененную человеческую V-область L-цепи антитела к человеческому IL-6R, включающую: (1) остовные области (FRS) человеческой V-области L-цепи и (2) CDRS V-области L-цепи мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R и видоизмененную человеческую V-область H-цепи антител к человеческим IL-6R, включающую: (1) FRS человеческой V-области H-цепи и (2) CDRS V-области H-цепи мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R. Настоящее изобретение также представляет видоизмененную человеческую цепь антител к человеческим IL-6R, включающую: (1) человеческую C-область L-цепи и (2) V-область L-цепи, включающую человеческие FRS, и CDRS мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R ивидоизмененную H-цепь антитела к человеческим IL-6R, включающую:
(1) человеческую C-область H-цепи и
(2) V-область H-цепи, содержащую человеческие FRS и CDRS из мышиного моноклонального антитела к человеческим IL-6R. Настоящее изобретение к тому же еще представляет видоизмененное человеческое антитело к человеческому IL-6R, содержащее:
(A) L-цепь, включающую
(1) человеческую C-область L-цепи и
(2) V-область L-цепи, включающую человеческие FRS L-цепи и CDRS L-цепи мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R, и
(B) H-цепь, содержащую
(1) человеческую C-область H-цепи и
(2) V-область H-цепи, включающую FRS H-цепи и CDRS H-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческим IL-6R. Настоящее изобретение, кроме того, представляет ДНК, кодирующую полипептиды любого из вышеупомянутых антител или его части. Настоящее изобретение также представляет векторы, например векторы экспрессии, включающие вышеназванную ДНК. Настоящее изобретение к тому же представляет клетки-хозяева, трансформированные или трансфицированные вышеназванными векторами. Настоящее изобретение еще представляет процесс получения химерных антител к человеческим IL-6R и процесс получения видоизмененных человеческих антител к человеческим IL-6R. Фиг. 1 представляет векторы экспрессии, включающие промоторно/энхансерную систему человеческого цитомегаловируса (HCMV), применимую для экспрессии пептида настоящего антитела. Фиг. 2 является графиком, показывающим результаты ELISA для подтверждения способности настоящего химерного антитела AUK 12-20 связываться с человеческим IL-6R. Фиг. 3 является графиком, показывающим результат определения способности настоящего химерного антитела AUK 12-20 подавлять связывание IL-6R с человеческим IL-6R. Фиг. 4 является графиком, показывающим результат ELISA по связыванию настоящих химерных антител PM-1a и PM-1b с человеческим IL-6R. Фиг. 5 является графиком, показывающим определения по ELISA способности настоящих химерных антител PM-1a и PM-1b подавлять связывание IL-6 с человеческим IL-6R. Фиг. 6 является диаграммой строения первого варианта видоизмененной V-области H-цепи человеческого PM-1. Фиг. 7 является диаграммой строения первого варианта видоизмененной человеческой V-области L-цепи PM-1. Фиг. 8 представляет процесс создания плазмиды экспрессии HEF-12h-g









Клонирование ДНК, кодирующей мышиные V-области
Говоря точнее, чтобы клонировать ДНК, кодирующую V-области мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R, необходимо создание гибридомы как источника генов, которая продуцирует моноклональные антитела к человеческим IL-6R. В качестве такой гибридомы японская патентная заявка N 2-189420 описывает мышиную гибридому PM-1, которая продуцирует моноклональные антитела PM-1, и ее свойства. В справочных примерах 1 и 2 настоящей спецификации описывается процесс создания гибридомы PM-1. Авторы настоящего изобретения создали гибридомы AUK 12-20, AUK 64-7 и AUK 146-15, причем каждая продуцирует мышиные моноклональные антитела к человеческим IL-6R. Процесс создания этих гибридом описан в справочном примере 3 этой спецификации. Чтобы клонировать желаемую ДНК, кодирующую V-области мышиных моноклональных антител, гибридомные клетки гомогенизируются и суммарную РНК получают по общепринятому методу, описанному Chirgwin et al, Biochemistry 18, 5294, 1977. Затем вся РНК используется, чтобы синтезировать одноцепочечные ДНК по методу, описанному J. W. Larrick et al., Biotechnology 7, 934, 1989. Затем проводится специфическая амплификация соответствующей части кДНК по методу полимеразной цепной реакции (PCR). Для амплификации V-области к L-цепи мышиных моноклональных антител используются 11 групп олигонуклеотидных праймеров (мышиных каппа вариабельных; MKV), представленных в SEQ ID N: с 1 по 11 и олигонуклеотидный праймер (мышиных каппа константных; МКС), представленный в SEQ ID N: 12, в качестве 5'-терминальных праймеров и 3'-терминальных праймеров соответственно. MKV праймеры гибридизируются с ДНК-последовательностью, кодирующей лидерную последовательность мышиной L-цепи, и МКС праймер гибридизируется с ДНК последовательностью, кодирующей константную область мышиной L-цепи. Для амплификации V-области H-цепи мышиных моноклональных антител используются 10 групп олигонуклеотидных праймеров (мышиных тяжелых вариабельных; MHV), представленных в SEQ ID N: с 13 по 22, и олигонуклеотидный праймер (мышиных тяжелых константных; MHC), представленный в SEQ ID N: 23 в качестве 5'-терминальных праймеров и 3'-терминального праймера соответственно. Заметим, что 5'-терминальные праймеры содержат нуклеотидную последовательность GTCGAC ближе к его 5'-концу, последовательность, которая представляет сайт расщепления рестрикционного фермента sal 1, и 3'-терминальный праймер содержит нуклеотидную последовательность, которая представляет сайт расщепления рестрикционного фермента Xma 1. Эти сайты расщепления рестрикционных ферментов используются для субклонирования фрагментов ДНК, кодирующих вариабельную область, в клонирующие векторы. Затем продукт амплификации расщепляется рестрикционными ферментами sal 1 и Xma 1, чтобы получить фрагмент ДНК, кодирующий желаемую область V-мышиных моноклональных антител. С другой стороны подходящий клонирующий вектор, такой как плазмида pUC19, расщепляется теми же самыми рестрикционными ферментами sal 1 и Xma 1, и вышеуказанный фрагмент ДНК связывается с расщепленной pUC19, чтобы получить плазмиду, включающую фрагмент ДНК, кодирующий желаемую V-область мышиных моноклональных антител. Секвенирование клонированной ДНК может быть осуществлено с помощью общепринятых методов. Клонирование желаемой ДНК и ее секвенирование детально описаны в примерах от 1 до 3. Области, определяющие последовательность (CDRS)
Настоящее изобретение представляет гипервариабельные или определяющие комплементарность области (CDRS)каждой V-области настоящего изобретения, V домены каждой пары L- и H-цепей из сайта связывания антигена. Домены L- и H-цепей имеют ту же самую структуру, и каждый домен содержит четыре основные области (FRS), чьи последовательности относительно сохранны, соединенные тремя CDRS (смотрите Kabat, E.A. Wu, T.T., Bilofsky, H, Reid-Miller, M. and Perry, H. , in "Sequences of Proteins of Immunological Interest", US Dept. Health and Human Services, 1983). Четыре FR главным образом принимают


Перед разработкой видоизмененных человеческих V-областей антител к человеческим IL-6R необходимо подтвердить, что CDR, которые будут использованы на деле, образуют эффективную область связывания антигена. С этой целью создавались химерные антитела. Кроме того, аминокислотные последовательности V-областей мышиных против человеческих IL-6R антител, предсказанные исходя из нуклеотидных последовательностей клонированных ДНК 4 мышиных моноклональных антител, описанных в примерах 1 и 2, сравнили друг с другом и с V-областями из известных мышиных и человеческих антител. Для каждого из 4 мышиных моноклональных антител был клонирован набор типичных функциональных V-областей L- и H-цепей. Все четыре мышиные анти-IL-6R антитела, однако, имели относительно различные V-области. Четыре антитела не были просто незначительными вариациями одно другого. При использовании клонированных мышинах V-областей были созданы 4 химерных анти-IL-6R антитела. Основной метод создания химерных антител включает соединение мышиных лидерной последовательности и последовательности V-области, как обнаружено при клонировании с применением PCR кДНК, с последовательностью, кодирующей человеческие C-области, уже присутствующей в векторах экспрессии клеток млекопитающих. Среди вышеуказанных 4 моноклональных антител создание химерных антител из моноклональных антител AUK 12-20 описано в примере 5. Создание химерных антител из моноклональных антител PM-1 описывается в примере 6. кДНК, кодирующая лидерную и V-область L-цепи мышиных PM-1, была субклонирована с PCR в вектор экспрессии, содержащий геномную ДНК, кодирующую человеческую каппа C-область. кДНК, кодирующая лидерную и V-области H-цепи мышиных PM-1 была субклонирована с PCR в вектор экспрессии, содержащий геномную ДНК, кодирующую человеческую гамма-I C-область. При использовании специально разработанных праймеров PCR кДНК, кодирующие V-область мышиных PM-1, были адаптированы на их 5'- и 3'-концах (1) так, чтобы они легко встраивались бы в векторы экспрессии и (2) так, чтобы они функционировали бы соответствующим образом в этих векторах экспрессии. Модифицированные PCR V-области мышиных PM-1 затем встраивались в векторы экспрессии HCMV, уже содержащие желаемые человеческие C-области (фигура 1). Эти векторы пригодны для или кратковременной или постоянной экспрессии генетически разработанных антител в ряде линий клеток млекопитающих. В дополнение к созданию химерных антител PM-1 с V-областями, идентичными V-областям, присутствующим в мышиных антителах PM-1 (вариант a), был создан второй вариант химерных антител PM-1 (вариант b). У химерных антител PM-1 (вариант b) аминокислота в положении 107 V-области L-цепи была заменена с аспарагина на лизин. При сравнении V-области L-цепи мышиных антител PM-1 с другими V-областями L-цепей было замечено, что появление аспарагина в положении 107 было необычным явлением. В V-областях L-цепей мыши наиболее типичной аминокислотой в положении 107 является лизин. Чтобы оценить значение наличия атипичной аминокислоты аспарагина в положении 107 V-области L-цепи мышиных антител PM-1, положение 107 изменялось на типичную аминокислоту лизин в этой позиции. Это изменение достигалось при использовании метода мутагенеза с PCR (M. Kamman et al., Nucl. Acids Res. (1989) 17:5404), чтобы произвести необходимые изменения в последовательностях ДНК, кодирующих V-область L-цепи. Вариант (a) химерных антител PM-1 проявлял активность по связыванию с человеческими IL-6R. Вариант b химерных антител PM-1 связывается с человеческими IL-6R так же, как и вариант (a). Подобным же образом из 2 других моноклональных антител AUK 64-7 и AUK 146-15 были созданы химерные антитела. Все 4 химерных антитела хорошо связываются с человеческими IL-6R, показывая таким образом в функциональном исследовании, что нужные мышиные V-области были правильно клонированы и секвенированы. Из 4 мышиных против-IL-6R антител антитела PM-1 были выбраны в качестве первого кандидата для разработки и создания видоизмененных человеческих антител к человеческим IL-6R. Выбор мышиных антител PM-1 основывался главным образом на результатах, полученных при изучении действия мышиных против-IL-6R антител на человеческие опухолевые миеломные клетки, трансплантированные безволосым мышам. Из 4 мышиных против-IL-6R антител антитела PM-1 показали наивысшую активность против опухолевых клеток. Сравнение V-областей из мышиных моноклональных антител PM-1 с V-областями из известных мышиных и человеческих антител
Для того чтобы создать видоизмененные человеческие антитела, причем CDR мышиных моноклональных антител пересаживаются в человеческие моноклональные антитела, желательно, чтобы существовала высокая гомология между FR мышиных моноклональных антител и FR человеческих моноклональных антител. Поэтому аминокислотные последовательности V-областей L- и H-цепей из мышиных антител PM-1 сравнивались со всеми известными мышиными V-областями, какие находятся в базе данных OWL (или Leeds) белковых последовательностей. Что касается V-областей мышиных антител, V-область L-цепи антитела PM-1 была наиболее подобна V-области L-цепи мышиного антитела musigkcko (Chen, H. -T. et al. , J. Biol. Chem. (1987) 262:13579-13583) с идентичностью 93,5%. V-область H-цепи антител PM-1 была наиболее подобна V-области H-цепи мышиных антител musigvhr 2 (F.J. Grant et al., Nucl. Acids Res. (1987) 15: 5496) с идентичностью 84,0%. V-области мышиных PM-1 показывают высокий процент идентичности с известными мышиными V-областями, свидетельствуя таким образом, что V-области мышиных PM-1 являются типичными мышиными V-областями. Это представляет дополнительное непрямое доказательство, что клонированные последовательности ДНК являются правильными. Присутствует, обычно, более высокий процент идентичности между V-областями L-цепи, чем между V-областями H-цепи. Возможно это связано с меньшим числом различий, обычно наблюдаемым в V-областях L-цепи по сравнению с V-областями H-цепи. Что касается V-областей человеческих антител, V-область L-цепи антител PM-1 была наиболее сходна с V-областью L-цепи человеческих антител Klhure, также упоминаемых как REI (W. Palm et al., Physiol. Chem. (1975) 356: 167-191) с идентичностью 72,2%. V-область H-цепи антител PM-1 была наиболее сходна с V-областью H-цепи человеческого антитела humighvap (VAP) (H.W. Schroeder et al. , Science (1987) 238: 791-793) с идентичностью 71,8%. Сравнение с человеческими V-областями наиболее важно для рассмотрения того, как разработать видоизмененные человеческие антитела исходя из мышиных антител PM-1. Процент идентичности с человеческими V-областями меньше, чем процент идентичности с мышиными V-областями. Это является непрямым доказательством того, что V-области мышиных PM-1 сходны с мышиными V-областями и не похожи на человеческие V-области. Эти данные также указывают на то, что для исключения проблем иммуногенности у больных людей наилучшим решением будет очеловечить V-области мышиных PM-1. V-области мышиных антител PM-1 также сравнили с соответствующими последовательностями различных подгрупп человеческих областей, как определено E.A. Kabat et al. ((1987) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Forth Edition, U.S. Department of Health and Humman servides, U.S. Government Printing (Office). Проведено сравнение FR-областей. Результаты представлены в таблице 1. FR V-области L-цепи мышиных PM-1 наиболее похожи на FR из соответствующей последовательности V-областей человеческих L-цепей подгруппы I (HSG I) с идентичностью 70,1%. FR V-области H-цепи мышиных PM-1 наиболее сходны с FR соответствующих последовательностей V-областей человеческих H-цепей из подгруппы II (HSG II) с идентичностью 52,9%. Эти результаты подтверждают результаты, полученные при сравнении с известными человеческими антителами. V-область L-цепи в человеческих REI принадлежит к подгруппе I V-областей L-цепей и V-области H-цепи в человеческих VAP относятся к подгруппе II человеческих V-областей H цепи. Исходя из этого сравнения с V-областями человеческих антител можно выбрать человеческие V-области, которые будут основой для разработки видоизмененных V-областей человеческих PM-1. Наилучшим было бы использование V-области человеческой L-цепи, которая принадлежит к подгруппе I (HSG II) для разработки видоизмененной V-области L-цепи преобразованных человеческих PM-1 и V-области человеческой H-цепи, которая относится к подгруппе II (HSG II) для разработки V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Разработка вариабельных областей видоизмененных человеческих PM-1
Первой стадией в разработке областей видоизмененных человеческих PM-1 был выбор человеческих V-областей, которые были бы основой разработки. FR V-области L-цепи мышиных PM-1 были наиболее сходны с FR V-областей человеческой L-цепи, относящихся к подгруппе I (таблица 1). Как обсуждалось выше, при сравнении V-области L-цепи мышиных PM-1 с известными V-областями L-цепи человека, они были наиболее сходны с V-областью REI L-цепи человека, члена подгруппы I V-областей человеческих L-цепей. При разработке V-областей L-цепи видоизмененных человеческих PM-1 были использованы FR из REI. Кроме того, FR REI использовались как стартовый материал для создания V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1. У этих человеческих FR на основе REI существует пять различий с FR первоначальных человеческих REI (положения 39, 71, 104, 105 и 107 по Kabat et al., 1987; см. таблицу 2). Три изменения в FR4 (положения 104, 105 и 107) базировались на J-области из другой человеческой каппа L-цепи и поэтому не представляют отклонения от человеческого (L. Riechmann et al., Nature (1988), 322: 21-25). Два изменения в положениях 39 и 71 были изменениями обратно к аминокислотам, которые присутствуют в FR V-области L-цепи крыс САМРАТН-1 (Riechmann et al., 1988). Были разработаны два варианта V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1. В первом варианте (вариант "a") человеческие FR были идентичны FR на основе REI, присутствующим в видоизмененных человеческих САМРАТН-1H (Riechmann et al., 1988) и мышиные CDR были идентичны CDR в V-области L-цепи мышиных PM-1. Второй вариант (вариант "b") базировался на варианте "a" с заменой только одной аминокислоты в положении 71 человеческой FR3. Остаток 71 является частью канонической структуры CDR 1 V-области L-цепи, как определено C.Chothia et al., (J. Mol. Biol (1987) 196 : 901-917). Предсказывается, что аминокислота в этом положении непосредственно влияет на строение петли CDR 1 V-области L-цепи и поэтому может значительно влиять на связывание антигена. В V-области L-цепи мышиных PM-1 в положении 71 находится тирозин. В модифицированных FR REI, использованных при разработке варианта "a" V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1 находился фенилаланин. В варианте "b" V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1 фенилаланин в положении 71 был заменен на тирозин, который обнаружен в V-области L-цепи мышиных PM-1. Таблица 2 показывает аминокислотные последовательности V-области L-цепи мышиных PM-1, FR REI которых модифицированы для использования в видоизмененных человеческих антителах CAMPATH-1H (Richmann et al., 1988) и двух вариантов V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1. FR V-области H-цепи мышиных PM-1 были наиболее сходны с FR V-областей H-цепи человека, принадлежащих к подгруппе II (таблица 1). Как обсуждалось выше, при сравнении V-области H-цепи мышиных PM-1 с известными V-областями H-цепей человека она наиболее сходна с V-областью VAP человеческой H-цепи, члена подгруппы II V-областей человеческих H-цепей. Последовательности ДНК, кодирующие FR V-области NEW человеческой H-цепи, другого члена подгруппы II V-областей человеческой H-цепи были использованы в качестве исходного материала для построения V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1 и как основа для разработки V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Было разработано шесть вариантов V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Во всех шести вариантах человеческие FR имели в основании FR NEW, присутствующие в видоизмененных человеческих CAMPATH-1H (Riechmann et al. , 1988), и мышиные CDR были идентичны CDR V-области H-цепи мышиных PM-1. Смесь аминокислотных остатков в человеческих FR (положения 1, 27, 28, 30, 48 и 71, см. таблицу 3), как было определено, имеют возможное побочное влияние на связывание антигена. B модели V-областей мышиных PM-1 остаток I V-области H-цепи является поверхностным остатком, который располагается близко к петлям CDR. Остатки 27, 28, 29 и 30 являются или частью канонической структуры CDR1 V-области H-цепи, как предсказано C.Chothia et al., Nature (1989) 34: 877-883, и/или, как наблюдается на модели V-областей мышиных PM-1, образуют часть первой структурной петли V-области H-цепи (Chothia, 1987). Остаток 48, как замечено на модели V-области мышиных PM-1, является спрятанным остатком. Изменения спрятанного остатка могут разрушать структуру V-области в целом и ее антиген-связывающий сайт. Остаток 71 является частью канонической структуры CDR2 V-области H-цепи, как предсказано Chothia et al., (1989). Шесть вариантов видоизменного человеческого антитела PM-1 включают различные комбинации изменений аминокислот в этих семи положениях человеческих FR NEW (см. таблицу 3). Создание видоизмененных V-областей человеческих PM-1. Первые варианты V-областей L- и H-цепей видоизмененных человеческих PM-1 каждый создавали, используя новый метод, основанный на PCR. В основном плазмидную ДНК, кодирующую видоизмененную V-область человека, которая уже содержала подходящие человеческие FR, модифицировали, используя праймеры PCR, чтобы заменить CDR, присутствующие в изначальной видоизмененной человеческой V-области CDR из мышиных антител PM-1. Исходный материал для построения видоизмененной V-области L-цепи человеческих PM-1 является плазмидной ДНК, видоизмененную V-область человеческой D1.3L-цепи. Видоизмененная V-область человеческой D1.3L-цепи создавалась на основе FR, присутствующих в V-области человеческой L-цепи REI. Исходным материалом для построения видоизмененной области H-цепи человеческих PM-1 была плазмидная ДНК, содержащая видоизмененную человеческую область D1.3H-цепи. Видоизмененная человеческая область D1.3H-цепи создавали на основе FR, присутствующих в V-области человеческой H-Цепи NEW (M.Verhoeyen et al., Science (1988) 239:1534-1536). Если исходные плазмидные ДНК, содержащие желаемые человеческие FR, уже выбраны, праймеры PCR предназначались для того, чтобы сделать возможным замещением CDR мышиных PM-1 CDR мышиных D1.3. Для каждой видоизмененной области человеческих PM-1 были разработаны и синтезированы три праймера, содержащих последовательности ДНК, кодирующие CDR мышиных PM-1, и два праймера, расположенных по краям полной последовательности ДНК, кодирующей видоизмененную человеческую V-область. Используя пять праймеров PCR в серии PCR, получали продукт PCR, который состоял из человеческих FR, присутствующих в исходной видоизмененной человеческой V-области и CDR, присутствующих в V-области мышиных PM-1 (см. пример 7 и фигуры 7 и 8). Продукты PCR клонировали и секвенировали, чтобы убедиться в том, что полная последовательность ДНК варианта "a" видоизмененной V-области L- и H-цепей человеческих PM-1 кодировала правильную аминокислотную последовательность (SEQ ID N 55). Остальные варианты видоизмененных областей человеческих PM-1 создавались с использованием небольших модификаций опубликованных методик мутагенеза с PCR (Kamman et al., 1989). Как описано для разработки видоизмененных областей человеческих антител PM-1, был создан один дополнительный вариант (вариант b) видоизмененной V-области L-цепи человеческих антител и получены пять дополнительных вариантов (варианты "b", "c", "d", "e" и "f") видоизмененной V-области H-цепи человеческих PM-1. Эти дополнительные варианты содержат серии незначительных изменений по сравнению с первыми вариантами. Разработаны праймеры, которые будут вводить необходимые изменения в последовательность ДНК. После серии PCR продукт PCR клонировали и секвенировали, чтобы убедиться, что изменения в последовательности ДНК такие, как запланировано. Последовательность варианта "f" V-области H-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1 показана в SEQ ID N 54. Если последовательности ДНК различных вариантов V-областей видоизмененных человеческих PM-1 подтверждались секвенированием, V-области видоизмененных человеческих PM-1 субклонировали в векторы экспрессии клеток млекопитающих, уже содержащие человеческие C-области. Видоизмененные V-области L-цепи человеческих антител PM-1 соединяли с последовательностями ДНК, кодирующими человеческую C-область. Видоизмененные V-области H-цепи человеческих PM-1 соединяли с последовательностями ДНК, кодирующими человеческие гамма-1 C-область. Чтобы достичь высоких уровней экспрессии видоизмененных человеческих антител PM-1, векторы экспрессии HCMV, как показано на фигуре 1, модифицировали. чтобы заменить промоторно-энхансерную область HCMV промотором-энхансером человеческого фактора элонгации (HEF-I) (см. фигуру 15). Затем все комбинации вариантов (a) и (b) видоизмененной человеческой L-цепи с вариантами от (a) до (f) V-области H-цепи испытывали на связанные с человеческими IL-6R и в результате видоизмененные человеческие антитела, включающие вариант (a) L-цепи и вариант (f) H-цепи, показали способность связываться с IL-6R на том же самом уровне, что и химерные PM-1 (a) (фиг. 13), что описано в деталях в примере II. Модификации последовательностей ДНК, кодирующих области видоизмененных человеческих PM-1 с целью улучшения уровней экспрессии. При рассмотрении уровней видоизмененных человеческих PM-1 антител, которые продуцируются cos клетками, стало очевидно, что уровни экспрессии видоизмененных человеческих H-цепей были всегда примерно в 10 раз ниже, чем уровни экспрессии видоизмененных человеческих L-цепей или химерных L- или H-цепей. По-видимому существует проблема в кодировании ДНК видоизмененной V-области человеческой H-цепи, что служит причиной низких уровней экспрессии. Чтобы определить были ли низкие уровни экспрессии белка результатом низких уровней транскрипции, получали PHK из cos клеток, трансфицированных одновременно векторами, экспрессирующими видоизмененные L- и H-цепи человеческих PM-1. Первично-цепочечная кДНК синтезировалась как описано для клонирования с PCR V-областей мышиных PM-1. Используя праймеры PCR, разработанные для расположения по концам ДНК, кодирующей V-области видоизмененных L- и H-цепей, продукты PCR получали с кДНК, которая соответствовала V-области видоизмененной человеческой L-цепи или видоизмененной V-области человеческой H-цепи. Для V-области видоизмененной L-цепи существовали два продукта PCR, один длиной 408 bp, как ожидалось, и более короткий продукт PCR длиной 299 bp. Продукт PCR правильного размера производился до уровня примерно 90% от общего выхода продукта PCR и более короткий продукт PCR производился на уровне примерно 10% от общего выхода. Для видоизмененной V-области человеческой H-цепи существовали также два продукта PCR, один длиной 444 bp, как ожидалось, и более короткий продукт PCR длиной 370 bp. В этом случае, однако, неправильный более короткий продукт PCR производился до преобладания в общем выходе продукта PCR, примерно в 90%. Продукт PCR правильного размера производился на уровне только примерно 10% от общего выхода продукта PCR. Эти результаты показали, что какое-то количество РНК, кодирующей видоизмененные человеческие V-области, содержит делеции. Чтобы определить, какие последовательности были стерты, более короткие продукты PCR клонировали и секвенировали. Исходя из последовательностей ДНК стало ясно, что как для V-областей L-цепи, так и H-цепи специфические части ДНК стерты. Изучение последовательностей ДНК, находящихся на концах стертых последовательностей, показано, что эти последовательности соответствовали согласованным последовательностям для соединения донорно-акцепторных последовательностей (Breathnach, R. et al., Ann. Rev. Biochem (1981) 50:349-383). Объяснение для низких уровней экспрессии видоизмененных человеческих H-цепей состояло в том, что конструкция V-областей видоизмененных человеческих H-цепей неумышленно создала довольно эффективный набор донорно-акцепторных сайтов сплайсинга. Кажется также, что разработка V-областей видоизмененных человеческих L-цепей неумышленно создала довольно неэффективный набор донорно-акцепторных сайтов сплайсинга. Чтобы удалить донорно-акцепторные места сплайсинга, были произведены незначительные модификации в последовательностях ДНК, кодирующих варианты "a" и "f" соответственно видоизмененных V-областей L- и H-цепей человеческих PM-1 с использованием методов мутагенеза с PCR, описанных выше. Другой возможной причиной сниженных уровней экспрессии, как полагали, являлось наличие интронов в лидерных последовательностях V-областей видоизмененных человеческих как L-, так и H-цепей (SEQ ID N0: 54 и 55). Эти интроны были первоначально получены из лидерной последовательности мышиной mu H-цепи (M.S.Neuberger er al., Nature 1985, 314: 268-270), которая была использована при построении видоизмененных человеческих D1.3 и V-областей. (Verhoeyen et al. , 1988). Так как видоизмененная D1.3 экспрессировалась в векторе клеток млекопитающих, в котором использовался мышиный иммуноглобулиновый промотор, наличие мышиного лидерного интрона было важным. Лидерный интрон содержит последовательности, которые важны для экспрессии из иммуноглобулиновых промоторов, но не с вирусных промоторов, подобных HCMV (M.S. Neuberger et al., Nucl. Acids Res. (1988) 16:6713-6724). Там, где видоизмененные человеческие L- и H-цепи PM-1 экспрессировались в векторах с использованием неиммуноглобулиновых промоторов, интроны в лидерных последовательностях утрачивались при клонировании с PCR кДНК, кодирующей видоизмененные человеческие V-области (см. пример 12). Другой возможной причиной сниженных уровней экспрессии, как полагали, являлось наличие протяженности примерно на 190 bp нефункциональной ДНК в интроне между видоизмененной V-областью H-цепи человеческих PM-1 и человеческой гамма-I C-областью. Видоизмененная V-область H-цепи человеческих PM-1 строилась из последовательностей ДНК, первоначально полученных из видоизмененной V-области H-цепи человеческих BI-8 (P. T. Jones et al., Nature (1986) 321: 522-525). Эту первичную видоизмененную человеческую V-область конструировали из V-области H-цепи мышиных NP (M.S. Neuberger et al., Nature (1985); M. S. Neuberger et al., EMBO J. (1983) 2:1373-1378). Эта протяженность в примерно 190 bp, находящаяся в интроне между видоизмененной V-областью человеческой H-цепи и сайтом Bam HI для присоединения видоизмененных человеческих V-областей к вектору экспрессии, удалялась при клонировании с PCR кДНК, кодирующей видоизмененные человеческие V-областти. Последовательности ДНК и аминокислот окончательных вариантов видоизмененных V-областей L- и H-цепей человеческих PM-1, которые изменены для улучшения уровней экспрессии, показаны в ID NOs: 57 и 56. Эти последовательности ДНК кодируют вариант "a" видоизмененной области цепи человеческих PM-1, как показано в таблице 2, и вариант "f" видоизмененной V-области H-цепи человеческих PM-1, как показано в таблице 3. При встраивании в векторы экспрессии HEF-1 (фигура 15) эти векторы временно продуцируют примерно 2 мкг/мл антител в трансфицированных cos клетках. Чтобы стабильно получать большие количества видоизмененных человеческих антител PM-1, был создан новый вектор экспрессии HEF-I




Гомология FR V-области kL-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20 с FR V-области человеческой kL-цепи подгруппы (HSG) I до IV и гомология FR V-области H-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20 с FR V-областей человеческой H-цепи подгруппы (HSG) I до III показаны в таблице 4. Как видно из таблицы 4, V-область kL-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20 гомологична в степени (64 по 68%) сходной с V-областью kL-цепи человека подгрупп (HSG) I по IV. При поиске в базе данных "LEEDS" на белок V-область L-цепи человеческих антител Len (M.Schneider et al., Physiol. Chem. (1975) 366: 507-557), принадлежащих к группе HSG-IV, проявляет наивысшую гомологию 68%. С другой стороны, человеческие антитела REI, использованные для построения видоизмененных человеческих антител из мышиных моноклональных антител PM-1, принадлежат к HSG-I, проявляют 62% гомологию с V-областью L-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20. Кроме того, CDR в V-области L-цепи AUK 12-20 антител, особенно CDR 2, лучше соответствовали каноническим структурам CDR в REI, чем таковым в LEN. Принимая во внимание вышеизложенное, нет необходимости выбирать человеческие антитела, используемые для очеловечивания V-области L-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20, из антител, принадлежащих к HSG IV. Поэтому, как в случае очеловечивания V-области L-цепи мышиных моноклональных антител PM-1, для гуманизации V-области L-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20 используются FR REI. Как показано в таблице 4, V-область H-цепи антител AUK 12-20 проявляет наивысшую гомологию с HSG I. Более того, при поиске в базе данных "LEEDS" человеческие антитела HAX (S'tollar, B.O. et al., J. Immunol. (1987) 139: 2496-2501), также принадлежащие к HSG I, проявляют примерно 66% гомологии с V-областью H-цепи антител AUK 12-20. Соответственно, чтобы разработать человеческую V-область H-цепи антител AUK 12-20, используются FR человеческих антител HAX, принадлежащих к HSG I, и FR очеловеченной V-области H-цепи антител 425, которые имеют FR, состоящие из соответствующей последовательности HSG I (Ketteborough C.A. et al., Protein Engineering (1991) 4: 773-783). Заметим, что V-область H-цепи антител AUK 12-20 проявляет примерно 64% гомологии с вариантом "a" очеловеченной V-области H-цепи антител 425. Разработка V-областей L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20. По вышеприведенной причине V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20 разрабатываются как указано в таблице 5, с использованием FR REI. Разработка V-областей H-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20. По вышеприведенной причине V-области H-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20 разрабатываются с использованием FR видоизмененных человеческих VHa 425. Обнаружено, однако, что нуклеотидная последовательность ДНК, кодирующей V-область H-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20, разработанная таким образом, имеет последовательность хорошо согласующуюся со сплайсинговой донорной последовательностью. Поэтому, как и в случае видоизмененных человеческих антител PM-1, существует возможность ненормального сплайсинга в видоизмененных человеческих антителах AUK 12-20. Поэтому нуклеотидная последовательность частично модифицировалась, чтобы убрать сплайсинговую донорноподобную последовательность. Модифицированная последовательность обозначается как вариант "a". Кроме того, варианты от "b" до "d" V-области H-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20 были дополнительно разработаны. Аминокислотные последовательности вариантов "a" до "d" представлены в таблице 6. Более того, варианты с "a" по "d" V-областей H-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20, разрабатываются как показано в таблице 7, с использованием FR человеческих антител HAX (J. Immunology (1987) 139: 2496 - 2501; антитела продуцировались клетками гибридомы 21/28, полученной из B клеток больного CKB; их аминокислотная последовательность описана на фиг. 6 и нуклеотидная последовательность ДНК, кодирующей аминокислотную последовательность, показана на фиг. 4 и 6 этого литературного источника). Для продукции настоящих химерных или видоизмененных человеческих антител к человеческим IL-6R может использоваться любая система экспрессии, включая эукариотические клетки, например клетки животных как утвердившиеся линии клеток млекопитающих, клетки грибов, дрожжевые клетки, такие как клетки E. coli. Предпочтительно настоящие химерные или видоизмененные человеческие антитела экспрессируются в клетках млекопитающих, таких как cos клетки или CHO клетки. В таких случаях может использоваться общепринятый промотор, применимый для экспрессии в клетках млекопитающих. Например, предпочтительно используется вирусная система экспрессии, такая как ранний промотор человеческого цитомегаловируса (HCMV). Примеры векторов экспрессии, содержащих промотор HCMV включают: HCMV-VH-HC








(1) L-цепь, включающую C-область человеческой L-цепи и область мышиной L-цепи; и
(2) H-цепь, включающую C-область человеческой H-цепи и V-область мышиной H-цепи. V-область мышиной L-цепи и V-область мышиной H-цепи и ДНК, кодирующая их, описаны выше. C-область человеческой L-цепи может быть любой C-областью человеческой L-цепи и, например, является человеческой Ck. C-область человеческой H-цепи может быть любой С-областью человеческой Н-цепи и, например, является человеческой C

Для продукции химерных антител создаются два вектора экспрессии, т.е. один, содержащий ДНК, кодирующую V-область мышиной L-цепи и C-область человеческой L-цепи контролем области контроля экспрессии, такой как энхансер/промоторная система, и другой, содержащий ДНК, кодирующую область мышиной H-цепи и C-область человеческой H-цепи под контролем области контроля экспрессии, такой как энхансер/промоторная система. Затем векторы экспрессии трансфицируются вместе в клетки-хозяева, такие как клетки млекопитающих, и трансфицированные клетки культивируются in vitro или in vivo для продукции химерных антител. Или же, иначе, ДНК, кодирующая V-область мышиной L-цепи и C-область человеческой L-цепи, и ДНК, кодирующая V-области мышиных H-цепей и C-область человеческой H-цепи, вводятся в единственный вектор экспрессии, и этот вектор используется для трансфицирования клеток-хозяев, которые затем культивируются in vivo или in vitro для продукции желаемых химерных антител. Настоящее изобретение, кроме того, представляет видоизмененное антитело к человеческому IL-6R, содержащее:
(A) L-цепь, включающую
(1) C-область человеческой L-цепи, и
(2) V-область L-цепи, содержащую FR человеческой L-цепи, и CDR-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R;
(B) H-цепь, включающую
(1) C-область человеческой H-цепи, и
(2) V-область H-цепи, содержащую FR человеческой H-цепи, и CDR H-цепи мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R. В предпочтительном воплощении CDR L-цепи имеют аминокислотные последовательности, представленные в любой из SEQ ID NOs: 24, 26, 28 и 30, причем протяженности аминокислотных последовательностей определены в таблице 9; CDR L-цепи имеют аминокислотные последовательности, показанные в любой из SEQ ID NOs: 25, 27, 29 и 31, причем протяженности аминокислотных последовательностей определены в таблице 9; FR человеческой L-цепи получают из REI, а FR человеческой H-цепи получают из NEW или HAX. В предпочтительном воплощении V-область L-цепи имеет аминокислотную последовательность, показанную в таблице 2, как PVLa; и V-область H-цепи имеет аминокислотную последовательность, показанную в таблице 3, как PVHa, PVHb, PVHc, PVHd, PVHe или PVHf. Аминокислотная последовательность PVHf наиболее предпочтительна. Для продукции видоизмененных человеческих антител созданы два вектора экспрессии, т.е. один, содержащий ДНК, кодирующую видоизмененную L-цепь, как определено выше, под контролем области контроля экспрессии, такой как энхансер/промоторная система, и другой, содержащий ДНК, кодирующую видоизмененную человеческую H-цепь, как определено выше, под контролем области контроля экспрессии, такой как энхансер/промоторная система. Затем векторы экспрессии вместе трансфицируются в клетки-хозяева, такие как клетки млекопитающих, и трансфицированные клетки культивируются in vitro или in vivo для продукции видоизмененных человеческих антител. Или же иначе, ДНК, кодирующая видоизмененную человеческую L-цепь, и ДНК, кодирующая видоизмененную H-цепь, вводятся в единственный вектор экспрессии, и этот вектор используется для трансфицирования клеток-хозяев, которые затем культивируются in vivo или in vitro для продуцирования желаемых видоизмененных человеческих антител. Химерные антитела из видоизмененных человеческих антител, полученные таким образом, могут быть выделены и очищены с помощью общепринятых методов, таких как аффинная хроматография на протеине A, ионообменная хроматография, гельфильтрация и тому подобное. Настоящая химерная L-цепь или видоизмененная человеческая L-цепь может быть соединена с H-цепью, чтобы получить полное антитело. Подобным же образом химерная H-цепь или видоизмененная H-цепь может быть соединена с L-цепью, чтобы получить целое антитело. Настоящее V-область мышиной L-цепи, V-область видоизмененной человеческой L-цепи, V-область мышиной H-цепи и V-область видоизмененной человеческой H-цепи являются по-существу областью, которая связывается с антигеном, человеческим IL-6R, и поэтому, как считают, применимы сами по себе или в качестве белка, соединяемого с другим белком, для получения фармацевтических препаратов или диагностических средств. Кроме того, данные CDR V-области L-цепи и CDR V-области H-цепи и являются по-существу областями, которые связываются с антигеном, человеческими IL-6R, и поэтому, как считают, применимы сами по себе или в качестве белка, соединяемого с другим белком, для получения фармацевтических препаратов или диагностических средств. ДНК, кодирующая V-область мышиной L-цепи настоящего изобретения, применима для построения ДНК, кодирующей химерную L-цепь, или ДНК, кодирующей видоизмененную человеческую L-цепь. Подобным же образом, ДНК, кодирующая V-область мышиной H-цепи данного изобретения, применима для построения ДНК, кодирующей химерную H-цепь, или ДНК, кодирующей видоизмененную человеческую H-цепь. Кроме того, ДНК, кодирующая CDR V-области L-цепи настоящего изобретения, применима для построения ДНК, кодирующей V-область видоизмененной человеческой L-цепь, и ДНК, кодирующей видоизмененную человеческую L-цепь. Аналогично, ДНК, кодирующая CDR V-области H-цепи настоящего изобретения, применима для построения ДНК, кодирующей видоизмененную человеческую H-цепь. Настоящее изобретение далее будет иллюстрироваться, но никоим образом не ограничиваться, следующими примерами. Пример 1. Клонирование ДНК, кодирующей V-область мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R (I)
ДНК, кодирующая V-область мышиного моноклонального антитела к человеческому IL-6R, клонировалась следующим образом. 1. Получение суммарной РНК
Суммарную РНК из гибридомы AUK 12-20 получали по методу, описанному Chirgwin et al, Biochemistry 18, 5294 (1979). А именно, 2,1

Чтобы синтезировать однонитевую кДНК по методу, описанному J.W. Larrick et al., Biotechnology 7.934 (1989), примерно 5 мкг суммарной РНК, полученной как описано выше, растворяли в 10 мкл 50 мМ Трис-HCl (pH 8,3) буферного раствора, содержащего 40 мМ KCl, 6 мМ Cl2, 10 мМ дитиотреитола, 0,5 мМ dATP, 0,5 мМ dGTP, 0,5 мМ dCTP, 0,5 мМ dTTP, 0,35 мкМ олиго dT праймера (Amersham). 48 единиц RAV-2 обратной транскриптазы (RAV-2: Rous Associated virus 2; Amersham) и 25 единиц человеческого плацентарного ингибитора рибонуклеазы (Amersham), и реакционную смесь инкубировали при 37oC в течение 60 минут и непосредственно использовали для последующего метода полимеразной цепной реакции. 3. Амплификация кДНК, кодирующей V-область антитела путем метода PCR
Метод PCR осуществляли, используя Thermal Cecler Model PHC-2 (Techne)
(1) Амплификация кДНК, кодирующей вариабельную область мышиной к легкой (kL)-цепи. Праймерами, использованными для метода PCR, были MKV (мышиные каппа вариабельные) праймеры, представленные в SEQ ID NO: от 1 до 11, которые гибридизуруются с лидерной последовательностью мышиной к L-цепи (S.T. Jones et al, Biotechnology, 9, 88, 1991) и МКС (мышиного каппа константного) праймера, представленного в SEQ ID NO: 12, который гибридизуется с мышиной C-областью L-цепи (S.T. Jones et al, Biotechnology, 9, 88, 1991). Сначала 100 мкл раствора PCR, содержащего 10 мМ Трис-CHl (pH 8,3), 50 мМ КCl, 0,1 мМ dATP, 0,1 мМ dGTP, 0,1 мМ dCTP, 0,1 мМ dTTP, 1,5 мМ MgCl2, 2,5 единиц ДНК-полимеразы Ampli Tag (Perkin Elmer Cetus), 0,25 мМ каждой группы MKV праймера, 3 мкМ МКС праймера и 1 мкЛ реакционной смеси синтеза однонитевой ДНК нагревали при начальной температуре 94oC в течение 1,5 минут и затем при 94oC в течение 1 минуты, при 50oC в течение 1 минуты и 72oC в течение 1 минуты, в этом порядке. После того как этот температурный цикл повторялся 25 раз, реакционную смесь дальше инкубировали при 72oC в течение 10 минут. (2) Амплификация кДНК, кодирующей V-область мышиной H-цепи. В качестве праймеров для PCR использовали МHV (мышиные тяжелые вариабельные) праймеры от 1 до 10 представлены в SEQ ID NO: с 13 до 22 (S.T. Jones et al., Biotechnology 9, 88, 1991) и MHC (мышиные тяжелые константные) праймер, представленный в SEQ ID NO: 23 (S.T. Jones et al., Biotechnology, 9, 88, 1991). Амплификацию проводили по той же самой методике, которая описана для амплификации гена V-области L-цепи в разделе 3.(I). 4. Очистка и расщепление продукта PCR
Фрагменты ДНК, амплифицированные PCR, как описано выше, очищали, используя набор для очистки продукта QIAGEN PCR (QIAGEN Inc, US), и расщепляли с помощью 10 единиц рестрикционного фермента Sal I (GIBCO BRL) в 100 мМ Трис-HCl (pH 7,6), содержащего 10 мМ MgCl2 и 150 мМ NaCl, при 37oC в течение трех часов. Расщепляющую смесь экстрагировали фенолом и хлороформом, и ДНК выделяли путем осаждения этанолом. Затем осадок ДНК расщепляли 10 единицами рестрикционного фермента Xma I (New England Biolabs) при 37oC в течение двух часов, и полученные в результате фрагменты ДНК разделяли путем электрофореза в агарозном геле, используя агарозу с низкой температурой плавления (FMC Bio Products USA). Агарозный участок, содержащий фрагменты ДНК длиной примерно 450 bp, вырезали и расплавляли при 65oC в течение 5 минут и затем добавляли равный объем 20 мМ Трис-HCl (pH 7,5), содержащего 2 мМ ЭДТА и 200 мМ NaCl. Смесь экстрагировали фенолом и хлороформом, и фрагмент ДНК выделялся путем осаждения этанолом и растворялся в 10 мкЛ 10 мМ Трис-HCl (pH 7,5), содержащего 1 мМ ЭДТА. Таким же путем получали фрагмент ДНК, содержащий ген, кодирующий V-область мышиной L-цепи, и фрагмент ДНК, содержащий ген, кодирующий V-область машиной H-цепи. Оба из вышеназванных фрагментов ДНК имели способный к соединению Sal I конец на их 5'-конце и способный к соединению Xma 1 конец на их 3'-конце. 5. Лигирование и трансформация
Примерно 0,3 мкг фрагмента ДНК Sal I - Xma I, содержащего ген, кодирующий V-область мышиной цепи L, полученного как описано выше, сшивали с примерно 0,1 мкг вектора pUC19, полученного путем расщепления плазмиды pUC19 с помощью Sal I и Xma I, в реакционной смеси, содержащей 50 мМ Трис-HCl (pH 7,4), 10 мМ MgCl2, 10 мМ дитиотреитола, 1 мМ спермидина, 1 мМ dATP, 0,1 мкг/мл бычьего сывороточного альбумина и 2 единицы Т4 ДНК-лигазы (New England Biolabs) при 16oC в течение 16 часов. Затем 7 мкЛ вышеприведенной смеси лигирования добавляли к 200 мкЛ компетентных клеток E. coli DH5

По существу тот же самый метод, что описан в примере 1, применялся в отношении гибридом PM-1, AUK 64-7 и AUK 146-15, чтобы получить следующие плазмиды:
плазмиду pPM-k3, содержащую ген, кодирующий V-область к L-цепи, полученный из гибридомы PM-1;
плазмиду pPM-h1, содержащую ген, кодирующий V-область H-цепи, полученный из гибридомы PM-1;
плазмиду p64-k4, содержащую ген, кодирующий V-область к L-цепи, полученный из гибридомы AUK 64-7;
плазмиду p64-h2, содержащую ген, кодирующий V-область h-цепи, полученный из гибридомы AUK 64-7;
плазмиду p146-k3, содержащую ген, кодирующий V-область к L-цепи, полученный из гибридомы AUK 146-15, и
плазмиду p146-h1, содержащую ген, кодирующий V-область H-цепи, полученный из гибридомы AUK 146-15. Заметим, что штаммы E. coli, содержащие вышеупомянутые плазмиды, были помещены на хранение в Национальную Коллекцию Промышленных и Морских бактерий, действующую в рамках Будапештского договора от 11 февраля 1991 года, и получили регистрационные номера, показанные в таблице 8. Пример 3. Секвенирование ДНК
Нуклеотидные последовательности кДНК кодирующей области в вышеупомянутых плазмидах определяли, используя набор Sequenase(тм) вариант 2.0 (U.S. Biochemical Corp. USA). Сначала примерно 3 мкг плазмидной ДНК, полученной как описано выше, денатурировали с помощью 2,0 N NAOH, ренатурировали с секвенирующим праймером и метили 35S-dATP по прописи поставщика. Затем меченную ДНК помещали на 6% полиакриламидный гель, содержащий 8 М мочевины, и после электрофореза гель фиксировали 10% метанолом и 10% уксусной кислотой, высушивали и подвергали ауторадиографии, чтобы определить нуклеотидную последовательность. Нуклеотидная последовательность кДНК колирующей области каждой плазмиды представлена в SEQ ID NO: с 24 до 31. Пример 4. Определение CDR. Основные структуры V-областей L-цепи и H-цепи похожи одна на другую, причем 4 остовные области (FR) связываются через 3 супервариабельные области, т. е. области, определяющие комплементарность (CDR). В то время как аминокислотные последовательности в FR относительно хорошо сохранны, аминокислотные последовательности в CDR очень высоко вариабельны (Kabat, E.A. et al. , "Sequences of Proteins of Immunological Interest", US Dept. Heath and Human Services 1983). На основе определенных выше аминокислотных последовательности V-областей мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R и по Kabat, E.A. et al., "Sequences of Proteins of Immunological Unterest", US Dept. Heath and Human Services, 1983, были определены CDR каждой V-области мышиных моноклональных антител к человеческим IL-6R, которые представлены в таблице 9. Пример 5. Подтверждение экспрессии клонированной кДНК (I)
(Создание химерных антител AUK 12-20)
Создание плазмиды экспрессии
Химерная L-цепь/H-цепь конструировалась из клонированной с PCR кДНК, кодирующей V-области к L-цепи и H-цепи AUK 12-20. Чтобы легко соединять кДНК, кодирующую V-область мышиных AUK 12-20 с ДНК, кодирующей человеческую C-область в векторе экспрессии в клетках млекопитающих, содержащем энхансер и промотор человеческого цитомегаловирусного ( HCMV) вектора экспрессии, необходимо ввести подходящие сайты расщепления для рестрикционного фермента в 5'- и 3' - концы мышиной кДНК. Эта модификация 5' -и 3'- концов выполнялась методом PCR. Были разработаны и синтезированы два набора праймеров. Запаздывающий праймер V-области L-цепи (SEQ ID NO:32) и запаздывающий праймер V-области H-цепи (SEQ ID NO: 33) были разработаны так, что праймеры гибридизуются с ДНК, кодирующей начало лидерной последовательности, сохраняют последовательность ДНК, необходимую для эффективной трансляции (Kazak M.J. Mol. Biol, 196: 947 - 950, 1987) и образуют сайт Hind III для клонирования в HCMV вектор экспрессии. Ранний праймер V-области L-цепи (SEQ ID NO: 34) и ранний праймер V-области H-цепи (SWQ ID NO: 35) разрабатывались так, что праймеры гибридизируют с ДНК, кодирующей концевую часть J-области, сохраняют последовательность ДНК, необходимую для сплайсинга в C-область и формируют сайт Bam НI для соединения с человеческой C-областью в HCMV вектора экспрессии. После амплификации путем PCR продукт PCR расщеплялся с помощью Hind III и Bam HI, клонировался в HCMV вектор, содержащий ДНК C-областей человеческих к и


Структуры экспрессирующих плазмид представлены на фиг. 1. В плазмиде HCMV-VL-HCK VL-область может быть любой V-областью мышиной L-цепи. В этом примере была встроена область к цепи AUK 12-20, чтобы получить HCMV-12k. В плазмиде HCMV-VH-HC


Временная экспрессия в cos клетках
Чтобы проследить временную экспрессию химерных AUK 12-20 антител в cos клетках, векторы экспрессии, сконструированные как описано выше, были испытаны на cos клетках. Вектор ДНК вводили в cos клетки путем электропорации, используя Gene Putsar аппарат (Bio Rad). А именно, cos клетки суспендировали в фосфатно-буферном физиологическом растворе (PBS) до клеточной концентрации 1

Супернатант культуры трансфицированных cos клеток исследовался с помощью ELISA для подтверждения продукции химерных антител. Чтобы определить химерные антитела плату покрывали козлиными против-человеческого IgG цельномолекулярным (Sigma). Плату блокировали и в каждую ячейку добавляли серийно разведенный супернатент из культуры cos клеток. После инкубации и промывания добавляли связанный с щелочной фосфатазой козлиный против-человеческого IgG (специфическая

Чтобы определить подавляют ли антитела, присутствующие в среде, связывание IL-6R с IL-6, плату покрывали моноклональными антителами MT18 (справочный пример 1). После блокирования добавляли растворимые рекомбинантные человеческие IL-6 (SR 344). После промывания добавляли серийно разведенные образцы из клеточной культуры cos в каждую ячейку с биотинированным IL-6. После отмывания добавляли стрептоавидин, связанный с щелочной фосфатазой, и после инкубации и отмывания добавляли субстратный буфер. Реакционную смесь инкубировали и после прекращения реакции измеряли оптическую плотность при 405 нм; очищенные мышиные моноклональные антитела AUK 12-20 добавляли в качестве положительного контроля, и культуральную среду cos клеток, экспрессирующих несвязывающие антитела, использовали в качестве отрицательного контроля. Результат показан на фиг. 3. Супернатант культуры cos клеток, трансфицированных генами, кодирующими химерные антитела AUK 12-20, проявляли связывание IL-6R с IL-6 при наивысших и вторых за наивысшими концентрациях. А именно, как показано закрашенными кружочками на фиг. 3, оптическая плотность при 405 нм изменялась в зависимости от разведения образца (концентрация антител), обнаруживая подавление связывания IL-6R с IL-6 антителами образца. Это, кроме того, подтверждается независимым соответствием изменения положительного контроля (открытые кружочки), зависящим от концентрации антител. Заметим, что отрицательный контроль не проявляет подавляющей активности (незакрашенные треугольники). Пример 6. Подтверждение экспрессии клонированной кДНК (2)
(Создание химерных антител PM-1)
Создание векторов экспрессии
Чтобы создать векторы, экспрессирующие химерные антитела PM-1, клоны кДНК pPM-k3 и pPM-h1, кодирующие V-область к L-цепи и H-цепи мышиных PM-1, соответственно модифицировали методом PCR и затем вводили в HCMV векторы экспрессии (см. фигуру 1). Были разработаны запаздывающие праймеры pmK-S (SEQ N0: 38) для V-области L-цепи и pmh-S (SEQ N0: 40) для V-области H-цепи, чтобы гибридизовать к ДНК последовательностям, кодирующим начало лидерных последовательностей, и чтобы получить согласующуюся последовательность Kozak и сайт рестрикции Hind III. Ранние праймеры pmk-a (SEQ N0: 36) для V-области L-цепи и pmh-a (SEQ N0: 39) для области H-цепи разработаны, чтобы гибридизовать к последовательностям ДНК, кодирующим концы J-областей и чтобы получить сплайсинговую донорную последовательность и сайт реструкции Bam HI. Для V-области каппа L-цепи были синтезированы два ранних праймера. Хотя в большинстве каппа L-цепей лизин в положении 107 сохраняется, в каппа L-цепи мышиных PM-1 в положении 107 находится аспарагин. Чтобы исследовать эффект этого изменения на активность химерных антител PM-1 по связыванию антигена, был разработан ранний праймер pmk-b (SEQ N0: 37), чтобы изменить положение 107 с аспарагина на лизин. После реакции PCR продукты PCR очищали, расщепляли с помощью Hind III и Bam HI и субклонировали в вектор pUC19 (Yanishe-Perron et al., Gene (1985) 33: 103 - 109). После секвенирования ДНК фрагменты Hind III - Bam HI вырезались и клонировались в вектор экспрессии HCMV-VH-HC


Векторы испытывали в cos клетках, чтобы обнаружить временную экспрессию химерных человеческих антител PM-1. HCMV-pmh-g


После 3 дней временной экспрессии среду от cos клеток отбирали и испытывали на наличие химерных антител PM-1. Сначала среду анализировали с помощью ELISA, чтобы определить продуцируются ли трансфицированными cоs клетками антитела подобные человеческим. Путем использования известных количеств очищенных человеческих IgG в качестве стандарта в этом исследовании можно также определить количество антител, подобных человеческим (в этом случае, химерные антитела PM-1), присутствующих в среде от cos клеток. Для определения человеческих антител платы покрывали козлиным противочеловечьим IgG (целые молекулы, Sigma). После блокирования образцы от cos клеток серийно разводили и добавляли в каждую ячейку. После инкубации и отмывания добавляли козий античеловеческий IgG, конъюгированный с щелочной фосфатазой (специфические гамма-цепи, Sigma). После инкубации и отмывания добавляли субстратный буфер. После инкубации реакцию останавливали и измеряли оптическую плотность при 405 нм. В качестве стандарта использовался очищенный человеческий IgG Sigma. Среда от cos клеток, трансфицированных векторами, несущими гены химерных PM-1, была положительной при исследовании на экспрессию антител, подобных человеческим, и примерные их количества определялись, как описано. Затем, та же самая среда от cos клеток, трансфицированных векторами, несущими гены химерных PM-1, исследовалась на способность связывать человеческие IL-6R. Для определения связывания с антигеном платы покрывали мышиными моноклональными антителами MT18 (справочный пример 1), антителами к человеческим IL-6R. После блокирования добавляли растворимые рекомбинантные человеческие IL-6R (SR 344). После отмывания образцы разводили серийно и добавляли в каждую ячейку. После инкубации и промывания добавляли козий противочеловеческий IgG (гамма-цепь специфическая, Sigma). После инкубации и промывания добавляли субстратный буфер. После инкубации реакцию останавливали и определяли оптическую плотность при 405 нм. Стандарта для этого исследования нет. Два образца были после трансфекации генов, кодирующих химерные антитела с V-областями, идентичными областям, обнаруженным в мышиных антителах PM-1 (химерных антителах PM-1a, фигура 4). Один образец был после трансфекции генами, кодирующими химерные антитела с заменой единственной аминокислоты, в положении 107 V-области L-цепи, как описано выше (химерные антитела PM-1b, фигура 4). Все образцы продемонстрировали сильное связывали с IL-6R, которое снижается с разбавлением образца. Таким образом, химерные антитела PM-1, которые сконструированы, являются функциональными и могут хорошо связываться с их антигеном. Наиболее важно, что демонстрация функциональности химерных PM-1 является прямым доказательством того, что были клонированы и секвенированы правильные V-области мышиных PM-1. Химерные антитела PM-1 с любой из двух аминокислот в 107 положении цепи хорошо связывались с их антигенами IL-6R. Очевидно, что положение 107 в V-области L-цепи мышиных PM-1 не является самым решающим в связывании антигена и что аспарагин или лизин в этом положении будут функционировать удовлетворительно. Так как мышиные антитела PM-1 имеют аспарагин в этом положении V-области L-цепи, вся дальнейшая работа с химерными антителами PM-1 выполнялась с вариантом, который имеет V-области, идентичные областям, обнаруживаемым в мышиных антителах PM-1. Чтобы стабильно получать большие количества химерных антител PM-1, был создан новый HCMV вектор экспрессии, включающий ген dhfr. Первым шагом в достижении более высоких уровней экспрессии химерных антител PM-1 была модификация вектора HCMV-Vн-HC









Антитела, продуцируемые трансфицированными клетками cos или устойчивыми линиями клеток CHO, исследовали, чтобы определить, могут ли эти антитела конкурировать с биотинилированным IL-6 за связывание с IL-6R. Платы покрывали мышиными моноклональными антителами MT18. После блокирования добавляли растворимые человеческие IL-6R (SR 344). После отмывания образцы из cos клеток серийно разводили и добавляли вместе с биотинилированными IL-6 в каждую ячейку. После отмывания добавляли стрептавидин, конъюгированный с щелочной фосфатазой. После инкубации и отмывания добавляли субстратный буфер. После инкубации реакцию останавливали и измеряли оптическую плотность при 405 нм. Результаты показаны на фиг. 5. Пример 7. Создание видоизмененных человеческих антител PM-1
Чтобы достичь переноса CDR более быстро и эффективно, был разработан метод секвенциального CDR-переноса путем PCR. Этот метод основан на методах PCR-мутагенеза (Kamman et al., 1989). Чтобы получить матричную ДНК, содержащую выбранные человеческие FR, для переноса CDR, было необходимо реклонировать соответственно измененные V-области в подходящие векторы. Плазмидные ДНК alys II и F10 кодируют видоизмененные человеческие D1.3 L- и H-цепи и содержат FR из человеческих REI и NEW соответственно. Фрагмент примерно 500 bp Ncol-Bam HI, содержащий ДНК-последовательность, кодирующую V-область видоизмененной D1.3 L-цепи, вырезался из alys II и субклонировался в расщепленную Hind III - Bam HI pBR327, чтобы получить вектор V1 - lys - pBR327. Фрагмент Hind III-Bam HI из V1 - lys-pBR327 встраивался в pUC19, расщепленную в Hid III-Bam HI, чтобы получить вектор V1 - lys - pUС19. Фрагмент примерно в 700 bp Ncol-Bam HI, содержащий ДНК последовательность, кодирующую V-область видоизмененной человеческой D1.3 H-цепи, вырезался из F10 и субклонировался в сайт Hind III-Bam HI вектора pBR327, с использованием Hind III-Ncol адаптора и получением Vh - lys - pBR327. Затем из этого вектора вырезался фрагмент Hind III - Bam HI и субклонировался в расщепленный Hind III-BamHI вектор pUC19 с получением Vh - lys - pUC19. Обратите внимание, что создание плазмиды alys II и последовательности ДНК, кодирующей V-область видоизмененной человеческой D1.3 L-цепи, использованных в матрице, описаны, ДНК последовательность, кодирующая V-область видоизмененной человеческой D1.3 H-цепи в плазмиде F10, использованной в качестве матрицы, описывается у V. Verhoey et al., Science 237: 1534-1536 (1988), фиг. 2. Фигура 6 показывает на схеме праймеры и реакции PCR, использованные при создании первого варианта V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Поздний праймер A (APCR1; SEQ N0: 41) и ранний праймер E (APCR4; SEQ N0 : 42) гибридизуются с ДНК последовательностями в векторе. Хотя для pUC19 вектора были в частности разработаны APCR1 и APCR4, могли бы использоваться и праймеры с универсальной последовательностью M13. Мутагенный праймер B CDR1-пересадки (phV-1; SEQ N0: 43), праймер C CDR1-пересадки (phv - 2; SEQ N0: 44) и праймер CDR3-пересадки (phV-3; SEQ N0: 45) были длиной 40-60 bp, состоящими из ДНК последовательностей, кодирующих CDR V-области H-цепи мышиных PM-1 и человеческие FR в матричной ДНК, которая находится по краям CDR областей. В первой реакции PCR использовались ранний праймер APCR4 и поздний праймер D. Первый продукт PCR, который содержит CDR3 последовательность мышиных PM-1, очищали и использовали во второй реакции PCR в качестве раннего праймера с праймером C в качестве позднего праймера. Тем же путем второй и третий продукты PCR, которые содержат CDR2 и CDR3 мышиных PM-1, и все три CDR мышиных PM-1 соответственно использовали в качестве праймеров в следующем этапе PCR. Четвертый продукт PCR, который имеет полную V-область H-цепи видоизмененных человеческих PM-1, очищали, разрезали Hind III и Bam HI и сублонировали в вектор pUC19 для дальнейшего анализа. Три мутагенных праймера phv-1, phv-2 и phv-3 были синтезированы для конструирования V-области H-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Они были очищены на 12% полиакриламидном геле, содержащем 8 М мочевины. Мутагенный праймер phv-1 был разработан не только для пересадки CDR1 мышиных PM-1, но также для замен в положениях 27 и 30 в человеческих FR1, Ser на Tyr и Ser на Thr соответственно. Каждые 100 мкл при реакции PCR обычно содержали 10 мМ Трис-HCl (pH 8,3), 50 мМ KCl, 1,5 мМ MgCl2, 250 мкМ dNTP, 50 нг матричной ДНК (Vh - lys - pUC19), 2,5 ед Amply Tag (Perkin Elmer Cetus) и праймеры. Первая реакция PCR при содержании 1 мкМ каждой из phv-3 и праймеров APCR4 проводилась после первоначальной денатурации при 94oC в течение 1,5 мин и 30 циклов при 94oC в течение 1 минуты, при 37oC в течение 1 мин и 72oC в течение 1 минуты были повторены. Время перерыва между отжигом и стадиями синтеза было установлено в 2,5 мин. После завершения последнего цикла следовало финальное развитие реакции при 72oC в течение 10 мин. Продукт PCR в 523 bp очищали, используя 1,6% агарозный гель с низкой температурой плавления, и затем использовали в качестве праймера во второй реакции PCR. Во второй реакции PCR в качестве праймеров использовали примерно 1 мкг очищенного первого продукта PCR и 25 пкМ мутагенного праймера phv-2. Условия PCR были теми же самыми, что описаны для первой реакции PCR. Таким же образом, продукт PCR 665 bp из второй реакции PCR и продукт PCR 737 bp из третьей реакции PCR использовались в качестве праймеров в третьей реакции PCR с праймером phv-1 и в четвертой реакции PCR с праймером APCR1 соответственно. Продукт PCR из четвертой реакции PCR очищали, разрезали Hind III и Bam HI и затем фрагмент примерно 700 bp, содержащий V-область H-цепи видоизмененных человеческих PM-1, субклонировали в вектор pUC19. Два из четырех секвенированных клонов имели последовательность ДНК, кодирующую правильную аминокислотную последовательность и были обозначены pUС-RVh-PM1a. Чтобы создать другие варианты V-области H-цепи видоизмененных PM-1, были синтезированы пять мутагенных праймеров PCR. Каждая реакция PCR в основном проводилась при тех же условиях, что описаны выше. Для варианта "b" были использованы: мугатенный праймер phv-4 (Val-71 до Arg-71; номер дан по Kabat et al; см. таблицу 3) (SEQ ID N0: 46) и APCR4 в первой реакции PCR с матричной ДНК, pUC-RVh-PM1a. Продукт PCR из этой первой реакции PCR очищался и использовался в качестве раннего праймера во второй реакции PCR с праймером APCR1. Продукт PCR из второй реакции PCR очищали, используя 1,6% агарозный гель с низкой температурой плавления, расщепляли с помощью Hind III и Bam HI и субклонировали в вектор pUC19, получая pUC-RVh-PM-1b. Таким же образом получали вариант "c" (pUC-RVh-PM-1c), используя мугатенный праймер phv-nm (Asp-1 до Gln-1) (SEQ ID N0:47) и матрицу pUC-RVh-PM-1b; вариант "d" pUC-RVh-PM-1d) получали, используя мутагенный праймер phv-m6 (11e-48 до Met-48) (SEQ ID N0: 48) и матрицу pUC-RVh-PM-1b; вариант "e" (pUC-RVh-PM-1e) получали, используя мутагенный праймер phv-6 и матрицу pUC-RVh-PM-1c; вариант "f" (pUC-RVh-PM-1f) получали, используя мутагенный праймер phv-7 (Thr-28 до Ser-28, Phe-29 до 11e-29) (SEQ ID N0: 49) и матрицу pUC-RVh-PM-1b. Аминокислотная последовательность варианта "f" V-области видоизмененной человеческой H-цепи и нуклеотидная последовательность, ее кодирующая, показаны в SEQ ID N0: 54. Фигура 7 представляет диаграммы праймеров и реакции PCR, использованные при создании первого варианта V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1. Для построения первого варианта V-области L-цепим видоизмененных человеческих PM-1 были синтезированы праймер переноса CDR1 pkv-1 (SEQ ID N0: 50), праймер переноса CDR2 pkv-2 (SEQ ID N0: 51) и праймер переноса CDR3 pkv-03 (SEQ ID N0:52) и очищали на 12% полиакриламидном геле, содержащем 8 М мочевину. Реакции PCR проводили как описано выше. Первая реакция PCR содержала 1 мкМ каждого pkv-3 и APCR4 праймера. Продукт PCR 350 bp из первой реакции PCR очищали, используя 1,5% агарозный гель с низкой температурой плавления, и использовали в качестве раннего праймера во второй реакции PCR. Продукт PCR из второй реакции PCR очищали, расщепляли Bam HI и Hind III и фрагмент 500 bp, содержащий пересаженную к CDR ДНК, субклонировали в вектор pUC19 или секвенирования ДНК. Была идентифицирована плазмидная ДНК, имеющая правильную последовательность и использована в качестве матричной ДНК в последующей реакции PCR. В третьей реакции PCR было использовано 25 пкмолей мутагенных праймеров pkv-2 и APCR4. Продукт PCR из третьей реакции PCR очищали и использовали в качестве праймера с праймером pkv-1 в четвертой реакции PCR. Таким же образом, продукт PCR из четвертой реакции PCR использовали в качестве праймера с праймером APCR1 в пятой реакции PCR. Продукт PCR 972 bp из пятой реакции PCR очищали, расщепляли Bam HI и Hind III и субклонировали в вектор pUC19 для секвенирования ДНК. Была определена проблема в области CDR2. Были необходимы дополнительные реакции PCR. В шестой и седьмой реакциях PCR продукт PCR из пятой реакции PCR, который клонирован в вектор pUC19, использовался в качестве матричной ДНК. В шестой реакции PCR праймерами были pkv-2 и APCR4. Продукт PCR из шестой реакции PCR очищали и использовали в качестве праймера с праймером APCR1 в седьмой реакции PCR. Продукт PCR седьмой реакции PCR очищали, расщепляли Bam HI и Hind III и фрагмент ДНК 500 bp субклонировали в вектор pUC19 для секвенированния ДНК. Два из пяти секвенированных клонов имели правильные последовательности. Клон был обозначен pUC-RVI-PM-1a. Последовательность показана в SEQ IN N0: 55. Для создания другого варианта V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1 был синтезирован мутагенный праймер pvK-mI (SEQ ID N0: 53). Реакции PCR были в основном такими, как описаны выше. В первой реакции PCR использовался мутагенный праймер pkv-mI (Phe-71 по Tyr-71) и праймер APCR4 с матричной ДНК pUC-RVI-PM-1a. Продукт PCR первой реакции PCR очищали и использовали в качестве праймера с праймером APCR1 во второй реакции PCR. Продукт PCR во второй реакции PCR очищали, расщепляли Bam HI и Hind III и субклонировали в вектор pUC19 для секвенирования ДНК. Клон обозначали pUC-RVI-PM-1b. Пример 8. Создание векторов, в которых используется ранний промотор человеческого цитомегаловируса (HCMV), для экспрессии генетически сконструированных антител в клетках млекопитающих (фиг. 1). Фрагменты ДНК, кодирующие V-области L- и H-цепей химерных PM-1, были первоначально встроены в векторы HCMV (HCMV-VL-HCk и HCMV-VH -HC



Фактор элонгации человеческих полипептидных цепей I














Чтобы удалить энхансерную последовательность из раннего промотора SV40, плазмидную ДНК pSV2-dhfr (S. Subramani et al., Mol. Cell. Biol. (1981) 1: 854-864) (АТСС 33694) расщепляли с помощью SphI и PVUII, заполняли полимеразой Кленова и подвергали самолигированию, чтобы получить pSV2-dhfr-





Сходный вектор создали на основе вектора экспрессии H-цепи, в котором используется HEF-I










HEF-I





Чтобы удалить интроны из последовательностей ДНК, кодирующих лидерные последовательности V-областей L- и H-цепи видоизмененных человеческих РМ-1 (смотрите SEQ ID N0s: 54 и 55), кДНК, кодирующую V-области, повторно клонировали, используя праймеры PCR. Векторы экспрессии L-и H-цепей RVI-PM-1a и RVh-PM-1f трансфицировали одновременно в cos клетки. После 48 часов получали суммарную РНК (Chirgwin et al, Biochemistry (1979) 18: 5294-5299) и 5 мкг суммарной РНК использовалось для синтеза первой нити кДНК, который описан для клонирования PCR V-областей мышиных антител. Были разработаны и синтезированы три PCR праймера. LEV-PI (SEQ ID N0: 60) и HEV-PI (SEQ ID N0: 58) содержат донорную последовательность спласинга и сайт Bam HI и были использованы в качестве ранних праймеров для V-областей L- и H-цепи соответственно. HEV-P2 (SEQ ID N0: 59) содержит согласующую последовательность Козака перед кодоном инициации ATG и сайт Hind III и использовался в качестве позднего праймера для обоих областей V как L-, так и H-цепи. Каждые 100 мкл из реакции PCR содержали 20 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 10 мМ KCl, 10 мМ (NH4)2O4, 2 мМ MgSO4, 0,1% Тритон X-100, 0,1 мкг BSA, 250 мкм dNTP. 2,5 ед. V-епт ДНК Полимеразы (Biofabs, U.K), 50% кДНК из реакции синтеза первой нити и 100 пкмолей каждого из раннего и позднего праймера. В каждую пробирку PCR наслаивали 50 мкл минерального масла и затем подвергали цикличному процессу после первоначального растворения при 94oC в течение 1,5 мин, при 94oC в течение 1 мин, при 50oC в течение 1 мин и 72oC в течение 1 мин и затем при 72oC в течение 10 мин. Продукт PCR 408 bp, содержащий V-область L-цепи, и продукт PCR 444 bp, содержащий V-область H-цепи, очищали, используя 2,0% агарозные гели с низкой температурой плавления, расщепляли Bam HI и Hind III и субклонировали в вектор pUC19, чтобы получить pUC-RVI-RCIa-3 и PUC-RVh-PM-1f-3 соответственно. Было обнаружено, что ДНК последовательности V-областей L- и H-цепи видоизмененных человеческих PM-1 содержат неподходящие донорные сплайсинговые и акцепторные сайты (смотрите SEQ ID N0s: 54 и 55). Сайты V-области в L-цепи используются нечасто (примерно 10% от мРНК), но сайты в V-областях H-цепи используются часто (примерно 90% от мРНК). Этот ненормальный сплайсинг приводил к низким уровням экспрессии видоизмененных человеческих антител PM-1. Чтобы исключить ненормальный сплайсинг в V-областях? донорные сайты спласинга удаляли, используя метод на основе PCR. Для V-области H-цепи синтезировали поздний праймер NEW-SPI (SEQ ID N0: 61) и ранний праймер NEW-SP2 (SEQ ID N0: 62), изменяя ДНК последовательность TGG GTG AGA на ДНК последовательность TGG GTT CGC. Условия для PCR реакций были описаны выше для клонирования кДНК, за исключением того, что матричной ДНК были 50 нг pUC-PVh-PM-1f-3 и праймерами были или HEV-P2 и NEW-SP2, или HEV-P1 и NEW-SP1. Продукты PCR из двух реакций PCR очищали, используя 2,0% агарозный гель с низкой температурой плавления, и использовали в соединяющей реакции PCR. 98 мкл реакционной смеси PCR с содержанием 0,5 мкг каждого из первичных продуктов PCR и 5 ед Vent ДНК полимеразы инкубировали при 94oC в течение 2 мин, при 50oC в течение 2 мин и 72o в течение 5 минут, а затем 100 пкмолей каждого из HEV-P1 и HEV-P2 праймеров добавляли. В пробирку PCR наслаивали 30 мкл минерального масла и подвергали 25 циклам PCR при 94oC в течение 1 мин, 50oC в течение 1 мин, и 72oC в течение 1 мин и затем инкубировали при 72oC в течение 10 мин. Подобным же образом донорный сайт сплайсинга в V-области L-цепи видоизмененных человеческих PM-1 удалялся при использовании праймеров PCR PEI-SPI (SEQ ID N0: 63) и PE-SP2 (SEQ ID N0: 64), что меняло ДНК последовательность CAG CTA AGG на ДНК последовательность CAG GAA AGG. Оба продукта PCR, фрагменты ДНК 408 bp для V-области L-цепи и фрагмент ДНК 444 bp для V-области H-цепи очищали с использованием 2,0% агарозного геля с низкой температурой плавления, расщепляли Hind III и Bam H1 и субклонировали в вектор pUC19 для получения pUC-RV1-PM1a-4 и pUC-RVh-PM1f-4 соответственно. RVh-PM1f-4 создавался путем замещения фрагмента Hind III-Bam HI RVh-PM-1f фрагментом Hind III-Bam H1, вырезанным из pUC-RVh-PM-1f-4. Последовательность варианта "a". V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1, причем интроны были удалены, показаны в SEQ ID N0: 57, и последовательность варианта "f" V-области H-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1, где удалены интроны, показана в SEQ IN N0: 56. Пример 13. Создание ДНК, кодирующей V-область L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20
Процесс создания ДНК, кодирующей V-область L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20, показан на фиг. 16. Ген, кодирующий V-область L-цепи человеческих антител, включается в вектор pUC19, при использовании ферментов рестрикции Hind III и Bam H1. Готовятся восемь праймеров PCR (от A до H) и амплифицируются в первых 4 областях PCR, которые образуют ген, кодирующий V-область. Праймеры A и H имеют гомологию к ДНК последовательностям вектора pUC19. Праймеры B, C и D являются праймерами длиной 40 и 60 bp каждый, имеющими генную последовательность CDR, которая должна быть перенесена соответственно. Праймеры E, F и G обладают гомологией к последовательности ДНК длиной от 15 до 20 bp 5'-конца праймеров B, C и D соответственно. В четырех первых PCR используют пары праймеров A и E, B и F, C и G, так же как D и H соответственно. Продукт PCR A-E кодирует FR1 и продукт PCR B-F кодирует CDR1 и FR2. 3'-концевая часть A-E фрагмента и 5'-концевая часть B-F фрагмента обладают гомологией на их отрезке в 15-20 bp, что позволяет объединить здесь фрагменты на более поздней стадии. Аналогично фрагмент B-F обладает гомологией с фрагментом C-G, который кодирует CDR2 и FR3. Фрагмент C-G, кроме того, обладает гомологией с фрагментом D-H, который кодирует CDR3 и FR4. Таким образом, эти четыре фрагмента могут соединяться с помощью их общей гомологии. После соединения этих 4 фрагментов в реакционной смеси PCR добавляют их праймеры A и H во второй реакции PCR, чтобы амплифицировать продукт, образованный при правильном соединении 4 фрагмента. Второй продукт PCR, полученный таким образом, имеет три пересаженные CDR-области и после расщепления Hind III и Bam HI, субклонируется в вектор pUC19. В частности, в качестве матрицы использовалась плазмида pUC-RV1-PM1a, созданная путем встраивания ДНК, кодирующей вариант "a" V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител PM-1, в плазмиду pUC19. Последовательность праймеров от A до H приведена в табл. 10. Поздние праймеры 1220-L1, 1220-L2 и 1220-L3 для CDR переноса очищали с помощью 12% полиакриламидного геля, содержащего 8 М мочевины, перед тем, как их использовать. 100 мкл реакционной смеси PCR содержали 20 мМ Трис-HCl (pH 8,8), 10 мМ KCl, 10 мМ (NH4)2SO4, 2 мМ MgSO4, 0,1% Тритон Х-100, 1 мкг БСА, 250 мМ dUTP, 5 единиц Vent ДНК-полимеразы (Biolabs, U.K.), 50 нг pUC-RV1-PM1a-4 ДНК и 100 пкмолей каждого из ранних и поздних праймеров. В каждую пробирку PCR наслаивали 50 мкл минерального масла и после первоначальной денатурации при 94oC в течение 1,5 минут проводили 30 циклов реакции при 94oС в течение 1 минуты, 50oC в течение 1 минуты и 72oC в течение 1 минуты, за чем следовала инкубация при 72oC в течение 10 минут. Каждый из продуктов PCR, 252 bp (A-E), 96 bp (B-F), 130 bp (C-G) и 123 bp (D-H) очищали с помощью 2,0% агарозного геля с низкой температурой плавления (FMC. Biо Products, USA) А именно, часть агарозного геля, содержащего фрагмент ДНК, вырезалась, расплавлялась при 65oC в течение 5 минут и добавлялась к тому же объему 20 мМ Трис-HCl (pH 7,5), содержащего 2 мМ ЭДТА и 200 мМ NaCl. Смесь экстрагировали фенолом и хлороформом. Фрагмент ДНК выделяли путем осаждения этанолом, растворяли в 10 мМ Трис-HCl (pH 7,5), содержащего 1 мМ ЭДТА, и использовали для реакции соединения PCR. Затем 98 мкл реакционной смеси PCR, содержащей 0,2 мкг каждого из продуктов первой PCR и 6 единиц Vent ДНК-полимеразы, инкубировали при 94oС в течение 2 минут, 50oC в течение 2 минут и 72oC в течение 5 минут для реакции соединения. Затем 100 пкмолей каждого из праймеров A (обратные) и H (универсальные) добавляли к реакционной смеси, чтобы довести ее до объема 100 мкл, и на реакционную смесь наслаивали 50 мкл минерального масла и подвергали 30 циклам реакции при 94oC в течение 1 минуты, 50oC в течение 1 минуты и 72oC в течение 1 минуты, за чем следовала инкубация при 72oC в течение 10 минут. Второй продукт PCR длиной 558 bp, содержащий V-область L-цепи, в которую перенесены CDR L-цепи мышиных моноклональных антител AUK 12-20, очищали на 2,0% агарозном геле с низкой температурой плавления и после расщепления с помощью Bam HI и Hind III субклонировали в pUC19 вектор, чтобы получить pUC-RLL-1220a, и секвенировали. Полученная в результате аминокислотная последовательность V-области L-цепи и нуклеотидная последовательность, кодирующая аминокислотную последовательность, показаны в SEQ IN N0: 71. Затем для создания вектора экспрессии L-цепи фрагмент Hind III-Bam HI ДНК, содержащий V-область L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20 вырезался из вышеупомянутой плазмиды pUC-RLL-1220a и встраивался в сайт Hind III-Bam HI вектора HEF-12k-gk экспрессии L-цепи, чтобы получить вектор экспрессии RVL-1220a для варианта "а" V-области L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20. Пример 14. Экспрессия и анализ L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20
Временная экспрессия в cos клетках
Вектор экспрессии RVL-1220a для L-цепи видоизмененных человеческих антител AUK 12-20 и вектор экспрессии HEF-12h-g












Формула изобретения

РИСУНКИ
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3, Рисунок 4, Рисунок 5, Рисунок 6, Рисунок 7, Рисунок 8, Рисунок 9, Рисунок 10, Рисунок 11, Рисунок 12, Рисунок 13, Рисунок 14, Рисунок 15, Рисунок 16, Рисунок 17, Рисунок 18, Рисунок 19, Рисунок 20, Рисунок 21, Рисунок 22, Рисунок 23, Рисунок 24, Рисунок 25, Рисунок 26, Рисунок 27, Рисунок 28, Рисунок 29, Рисунок 30, Рисунок 31, Рисунок 32, Рисунок 33, Рисунок 34, Рисунок 35, Рисунок 36, Рисунок 37, Рисунок 38, Рисунок 39, Рисунок 40, Рисунок 41, Рисунок 42, Рисунок 43, Рисунок 44, Рисунок 45, Рисунок 46, Рисунок 47, Рисунок 48, Рисунок 49, Рисунок 50, Рисунок 51, Рисунок 52, Рисунок 53, Рисунок 54, Рисунок 55, Рисунок 56, Рисунок 57, Рисунок 58, Рисунок 59, Рисунок 60, Рисунок 61, Рисунок 62, Рисунок 63, Рисунок 64, Рисунок 65, Рисунок 66, Рисунок 67, Рисунок 68, Рисунок 69, Рисунок 70, Рисунок 71, Рисунок 72, Рисунок 73, Рисунок 74, Рисунок 75, Рисунок 76, Рисунок 77, Рисунок 78, Рисунок 79, Рисунок 80, Рисунок 81, Рисунок 82, Рисунок 83, Рисунок 84, Рисунок 85, Рисунок 86, Рисунок 87, Рисунок 88, Рисунок 89, Рисунок 90, Рисунок 91, Рисунок 92, Рисунок 93, Рисунок 94, Рисунок 95ND4A Продление срока действия патента Российской Федерации на изобретение
Дата, до которой продлен срок действия: 25.04.2017
пп.4-16
Извещение опубликовано: 27.03.2010 БИ: 09/2010