Штамм актиномицета streptomyces lydicus для защиты растений от грибковой инфекции, композиция для защиты растений от грибковой инфекции (варианты), способ снижения чувствительности растения к грибковой инфекции (варианты)
Изобретение относится к биотехнологии, в частности к новому штамму актиномицетов, способному ингибировать рост фитопатогенов и усиливать рост растений, к средствам защиты растений от грибковой инфекции и снижению чувствительности растений к грибковой инфекции. Штамм актиномицета Streptomyces lydicus WYEC 108 выделен из почвы, депонирован в Американской коллекции типовых культур (АТСС) под 55445. Ингибирует рост таких фитопатогенов, как Pythium ultimum, Phanerochaete chrysosporium, Coryolus versicolor, Rhizoctonia solani, Fusarium sambucinetum. На основе вышеуказанного штамма создана композиция, содержащая штамм и доставочную среду, включающую по крайней мере один из компонентов: альгинатный гель, торфяной мох, песок, кукурузную муку. Дополнительно может включаться и источник азота в виде хлорида аммония. Способ снижения чувствительности растения к грибковой инфекции предусматривает обработку корней или семян вышеуказанным штаммом или композицией, содержащей штамм. Данные изобретения позволяют защитить растения от фитопатогенных грибов и стимулировать рост растений. 5 с. и 6 з.п. ф-лы, 9 табл.
Изобретение относится к новому штамму бактерий, способному ингибировать рост патогенов растений почвенного происхождения и усиливать рост растений.
Грибковые фитопатогены являются причиной больших экономических потерь в сельском хозяйстве и садоводстве. Было описано множество различных типов грибковых фитопатогенов: эти патогены вызывают болезни растений, такие как вызревание, белая гниль, бурая гниль и корневая гниль. Такие болезни могут погубить появляющиеся проростки, снизить мощность растений и неблагоприятно повлиять на урожай. Для того чтобы свести к минимуму грибковые инфекции, можно выращивать рассаду на почве, простерилизованной паром или обработанной химическим способом. Однако подобные обработки уничтожают в почве и полезные микроорганизмы, которые в нормальных условиях конкурируют с почвенными грибами. В этих условиях, если в почву будет случайно занесен грибковый патоген, он может быстро распространиться и вызвать широкое распространение болезни. В сельскохозяйственном производстве почвы, зараженные фитопатогенными грибами, являются неподходящими для выращивания определенных культур. Например, урожаи соевых бобов в Мичигане и в других штатах, выращивающих сою, часто сильно уменьшаются вследствие корневой гнили, вызванной грибом Phytophera megasperma (Filinow and Lockwood, 1985). Виды гриба Pythium широко распространены на части земель в Калифорнии, штате Вашингтон и Айдахо. Pythium ultimum является наиболее часто встречающимся патогенным видом, ответственным за выпревание проростков до и после прорастания. Этот вид является серьезным патогеном пшеницы, гороха и турецкого гороха и других культур, которые выращиваются на этих почвах и на почвах других штатов и других стран (Trapero-Casas и др. , 1990; Stanghellini и Hancock, 1970; Kraft и Burke, 1971; Westerlund и др. , 1988). Применение химических агентов для контроля грибковых фитопатогенов часто не является практичным, так как они дорого стоят, малоэффективны и вызывают появление резистентных штаммов грибов. Помимо этого применение химических фунгицидов нежелательно с точки зрения экологии. В патенте США N 4595589 описываются штаммы актиномицетов Streptomyces для защиты растений от грибковой инфекции. Кроме того, раскрывается композиция для защиты растений от грибковых инфекций, содержащая актиномицеты Streptomyces и доставочную среду в виде торфа. Целью настоящего изобретения явилось создание средств биологического контроля для снижения инфекций растений, вызванных грибковыми патогенами. Поставленная цель была достигнута путем выделения ряда актиномицетов, активных в отношении ингибирования роста грибковых фитопатогенов. В частности, было показано, что один из выделенных актиномицетов, который в настоящем документе именуется Streptomyces WYEC 108 (также упоминается здесь как WYEC 108), демонстрирует сильный антагонизм в отношении целого ряда грибковых патогенов растений, включая патогены, вызывающие болезни растений, известные как выпревание, корневая гниль, белая гниль и бурая гниль. Так одной особенностью настоящего изобретения является биологически чистая культура Streptomyces WYEC 108. Настоящее изобретение также предлагает различные композиции, удобные для обработки семян или корней растений штаммов Streptomyces WYEC 108. Такие композиции полезны для снижения чувствительности растений к грибковой инфекции и для усиления роста обработанных растений. В предпочтительном варианте осуществления изобретения такие композиции включает биологически чистую культуру Streptomyces WYEC 108 и доставочную среду. В некоторых вариантах осуществления изобретения доставочная среда может включать альгинатный гель, песок или кукурузную муку. В одном варианте осуществления настоящего изобретения поставочная среда, которая включает торфяной мох, песок и кукурузную муку, объединена со Streptomyces WYEC 108. В другом варианте осуществления изобретения доставочная среда включает по меньшей мере 105 колониеобразующих единиц на 1 г доставочной среды. В еще одном варианте осуществления изобретение включает в себя гранулы альгинатного геля, содержащие Streptomyces WYEC 108. Такие гранулы можно непосредственно добавлять к корням растущих растений или вносить в почвы для земледелия или садоводства для уменьшения повреждения растений, вызванного фитопатогенными грибами. Настоящее изобретение включает также способы снижения чувствительности растений к грибковой инфекции. В одном варианте осуществления изобретения этот способ включает в себя доставку Streptomyces WYEC 108 к корням растения. В другом варианте осуществления изобретения этот способ включает в себя погружение семян в композицию, содержащую Streptomyces WYEC 108, а затем высаживание обработанных семян в подходящую ростовую среду. В этом способе подходящая композиция включает в себя альгинатный гель, содержащий Streptomyces WYEC 108. Настоящее изобретение описывает выделение ряда штаммов актиномицетов из почвы. Ряд этих штаммов продемонстрировал свою эффективность в снижении эффектов грибковых патогенов на растения, включая латук, турецкий горох и перец. В частности, настоящее изобретение предлагает выделение штамма, называемого в настоящем документе Streptomyces WYEC 108. Показано, что штамм YEC 108 демонстрирует сильный антагонизм в отношении широкого ряда грибковых фитопатогенов, включая патогены, вызывающие выпревание проростков до и после прорастания, корневую гниль, бурую гниль и белую гниль. В качестве такого антагониста штамм WYEC 108 особенно удобен в качестве биоконтролирующего агента, который можно использовать для защиты растений от инфицирования этими фитопатогенами. Так, Streptomyces WYEC 108 является полезным для использования в способах снижения чувствительности растений к грибковой инфекции. Благодаря этому, растения, обработанные Streptomyces WYEC 108, менее подвержены воздействию грибковой инфекции. Грибковая инфекция чувствительных необработанных растений влияет на некоторые ростовые характеристики этих растений. Например, необработанные растения, зараженные грибковыми патогенами, могут демонстрировать значительное снижение высоты, биомассы и урожайности по сравнению с растениями, не зараженными грибковым патогеном. В предпочтительных вариантах осуществления настоящего изобретения растения, обработанные Streptomyces WYEC 108 и затем зараженные грибковым патогеном, демонстрируют менее выраженные снижения высоты, биомассы и урожайности, чем необработанные растения, зараженные грибковым патогеном. В более предпочтительных вариантах осуществления настоящего изобретения растения, обработанные Streptomyces WYEC 108 и зараженные грибковым патогеном, демонстрируют те же ростовые характеристики, что и необработанные и незараженные растения. В наиболее предпочтительных вариантах осуществления настоящего изобретения растения, обработанные Streptomyces WYEC 108 и зараженные грибковым патогеном, демонстрируют ростовые характеристики, превосходящие таковые необработанных незараженных растений. Штамм WYEC 108 колонизирует корни растений в присутствии конкуренции микрофлоры ризосферы. Показано, что штамм WYEC 108 усиливает рост растений латука, выращиваемых на почве, стерилизованной паром, и растений перца, выращиваемых на открытом грунте. Настоящее изобретение также заключает в себе средства производства вегетативных клеток или спор штамма WYEC 108, подходящих для помещения их в доставочную среду. Показано, что композиция, включающая вегетативные клетки и споры WYEC 108 и доставочную среду, имеет длительный срок хранения и удобна для доставки штамма WYEC 108 к растениям. Материалы и методы. Среды для роста бактерий. Все среды для роста бактерий приготавливали, используя дистиллированную воду, и стерилизовали автоклавированием перед использованием. Все бактериальные образцы обрабатывались в соответствии со стандартными асептическими лабораторными методиками для поддержания чистоты. Среда YGM (дрожжевой экстракт/глюкоза/минеральные соли) включала 0,6% (вес/объем) дрожжевого экстракта (лаборатории Difco, Детройт, Мичиган), 1,0% (вес/объем) глюкозы и раствор фосфатных неорганических солей (5,3 г Na2HPO4, 1,98 г KH2PO4, 0,2 г MgSO4













Streptomyces WYEC 108 по отношению к грибковым патогенам in vitro
Способность Streptomyces WYEC 108 ингибировать рост ряда выбранных грибковых фитопатогенов измеряли степенью ингибирования роста колоний Streptomyces WYEC 108 сеяли штрихом на одну половину в центре чашек с кукурузным агаром (лаборатории Difco, Детройт, Мичиган). Инокулированные чашки инкубировали при 25oC в течение приблизительно 8 - 12 дней до образования культурами спор. Споруляцию определяли невооруженным глазом как массу серого воздушного мицелия и спор. Споруляцию определяли также под фазово-контрастным микроскопом (x 1000), 5-мм агаровый диск КА, содержавший активно растущий мицелий специфического грибкового фитопатогена, брали с ведущего края грибковой культуры и асептически переносили в центр чашки с агаром. Эти чашки инкубировали при 25oC до тех пор, пока тест-гриб не достигал края контрольной чашки, не содержавшего Streptomyces WYEC 108. Ингибирование грибкого роста оценивали количественно путем определения отношения радиального роста грибкового патогена под влиянием Streptomyces WYEC 108 к отдельному его росту на контрольных чашках. Процент ингибирования грибкового роста регистрировали спустя 48, 96 и 192 ч инкубации, в зависимости от выбранного патогенного гриба. Это исследование повторяли на пяти чашках, ингибирование измеряли по отдельности и выражали как среднее

Использование Streptomyces WYEC 108 для обработки семян
Эффективность Streptomyces WYEC 108 в отношении защиты растений от фитопатогенов определяли обработкой штаммов Streptomyces WYEC 108 непроросших семян турецкого гороха и последующим высевом этих семян на почву, зараженную грибковыми фитопатогенами P.ultimum и P.irregulare. Внеклеточные метаболиты, вырабатываемые штаммом WYEC 108, получали из культур путем экстракции. Эффект этих метаболитов на грибковую инфекцию прорастающих семян турецкого гороха также определялся. Рост Streptomyces WYEC 108. Для роста клеток штамма WYEC 108 1-литровые колбы Эрленмейера, содержавшие 500 мл YGM (pH 7,1-7,2) инокулировали 20 мл исходной культуры и инкубировали при встряхивании на 250 об/мин при 30oC в течение 3 дней для получения клеточной массы. Для получения противогрибковых метаболитов 1-литровые колбы Эрленмейера, содержавшие 500 мл CYD (pH 7,1-7,2), инокулировали 20 мл исходной культуры и инкубировали при встряхивании на 250 об/мин при 30oC в течение 7 дней. Обработка семян Streptomyces WYEC 108 и противогрибковыми метаболитами. Мицелиальную суспензию Streptomyces WYEC 108 собирали центрифугировали на 5000 об/мин в течение 10 мин 500 мл трехдневной жидкой YGM культуры. Собранный мицелий ресуспендировали в 200 - 300 мл стерильного 3%-ного (вес/объем) раствора альгинатта натрия до плотности культуры 1,0-1,2

1) 1 см торфяного мха укладывали на дно каждого горшка для предотвращения потери почвы и одновременного обеспечения аэрации и дренажа. 2) Горшки наполняли зараженной почвой. 3) Почву затем поливали водой до полного насыщения со стороны дна. После насыщения поверхности почвы на нее помещали необработанные и обработанные семена турецкого гороха, углубляли на 1,5-2,0 см и покрывали той же почвой. Покрытие становилось влажным в результате капиллярности почвы, поднимающей воду из столба влажной земли под покрытием. В каждый из трех горшков (повторности) засевали по десять семян. К почве не прибавляли удобрения. Для минимизации высыхания и предотвращения образования корки горшки покрывали чистой пластиковой пленкой до появления проростков. Начиная со времени появления проростков, на поверхность горшков распыляли добавочную воду, когда это требовалось. Эксперименты выполняли в теплице при 15 - 30oC с фотопериодом в 12 ч света и 12 ч темноты (16000 лк). Появление проростков подсчитывали периодически, а конечные их подсчеты производились по истечении 20 дней. Эти данные были представлены как средние величины для каждой обработки. Способность Streptomyces WYEC 108 действовать как биоконтролирующий агент основывалась на общем количестве проростков, высоте растений и сыром весе растений по сравнению с контрольными растениями, выросшими из необработанных биоконтролирующим агентом семян. Результаты этого эксперимента представлены в таблице VI. Как Streptomyces WYEC 108, так и противогрибковые метаболиты, вырабатываемые этими клетками, снижали выпревание турецкого гороха, вызванное Pythium. Растения демонстрировали мощный рост, если семена покрывались клетками Streptomyces WYEC 108. Наблюдалось значимое снижение высоты и сырого веса растений, появившихся из контрольных семян, по сравнению с теми же показателями растений, выросших из семян, покрытых клетками Streptomyces WYEC 108. Прорастание необработанных семян турецкого гороха было снижено в крайней степени (прорастание 6,7%) из-за гнили семян и выпревания до прорастания, вызванного P. ultimum, когда семена были высажены в почву, естественно зараженную P. ultimum и P. irregulare. В противоположность этому прорастание семян, обработанных клетками Streptomyces WYEC 108 перед посевом, составляло 63,3%. Семена, обработанные только альгинатом, не показали увеличения прорастания. Симптомы, типичные для корневой гнили, вызванной Pythium, включая потерю корневых волосков и обесцвечивание корней, были очевидными в собранных корнях турецкого гороха, выросших из контрольных семян; в то же время эти симптомы отсутствовали у растений, выросших из семян, обработанных клетками Streptomyces WYEC 108. В контроле повреждение турецкого гороха наблюдалось в основном в форме гниения семян и выпревания до прорастания. Проростки турецкого гороха, которые все же взошли и выросли, были низкорослыми, а их корни были сильно заражены P. ultimum. Прорастание семян турецкого гороха, обработанных противогрибковыми метаболитами в форме растворенного в эфире метаболита, была выше (33,3%), чем прорастание контрольных семян (6,7%), но ниже, чем прорастание семян, покрытых клетками Streptomyces WYEC 108. Растения, выросшие из семян, обработанных противогрибковыми метаболитами, демонстрировали мощный рост, более длинные корни и более высокую плотность корневых волосков по сравнению с контрольными растениями. Пример V. Влияние Streptomyces WYEC 108 на корневую инфекцию и гниль семян, вызванные Pythium ultimum. Проростки турецкого гороха, выросшие, как описано в примере IV, на почве, естественно зараженной Pythium ultimum, с предварительной обработкой WYEC 108 или без нее, изучались с целью определения влияния штамма WYEC 108 на P. ultimum инфекцию. Корневую инфекцию P. ultimum изучали с контрольными проростками турецкого гороха, собранными на 20-й день роста. P. ultimum, вызывающий корневую гниль, также был выделен из пораженных корней этих контрольных растений. Выделение P. ultimum было выполнено путем отмывания почвы от корней турецкого гороха (корешки и корневые волоски) водопроводной водой и ополаскивания их дважды стерильной дистиллированной водой. Обесцвеченные и тронутые гнилью корни измельчали в асептических условиях с помощью лезвия безопасной бритвы и помещали их на чашки с 3-дневным 2%-ным агаром. Чашки инкубировали 24-48 ч при комнатной температуре и просматривали под фазово-контрастным микроскопом (х 40). P. ultimum, растущий из зараженных корней турецкого гороха, рекультивировали на свежем 2%-ном агаре, а затем идентифицировали, как описано ранее (Ingram и Cook, 1990). Гниль семян, вызванную P. ultimum, изучали на тронутых гнилью контрольных семенах, собранных на 20-й день после посева. Часть гнилых семян асептически помещали на 3-дневный 2%-ный агар стерильной зубочисткой и инкубировали 24-48 ч при комнатной температуре. Чашки изучали, как описано выше. Pythium заражал корни необработанных растений турецкого гороха, росших на естественно зараженной почве. P. ultimum был превалирующим видом из тех, что выделяли из сгнивших семян и корней. P. irregulare встречался реже. Колонизацию корней Streptomyces WYEC 108 изучали на корнях 20-дневных растений турецкого гороха, которые выросли из семян, обработанных суспензией клеток Streptomyces WYEC 108 и альгината, описанной в примере II. Эти растения росли на почве, естественно зараженной P. ultimum и P. irregulare, также описанной в примере II. растения удаляли из горшков и осторожно отмывали водопроводной водой для удаления прилипшей ризосферной почвой. Затем их прополаскивали стерильной дистиллированной водой. Образцы корней подготавливали для микроскопии путем помещения кусочков корней на предметные стекла, добавления капли метиленового синего и покрывания покровным стеклом. Приготовленные образцы затем изучали под фазово-контрастным микроскопом (х 1000). Streptomyces WYEC 108, присутствующий на семенах, приходит в контакт с появляющимися корнями. По мере удлинения корней Streptomyces WYEC 108 продвигается вместе с ними на корневые волоски и верхушку корня. Наблюдалась обширная колонизация Streptomyces WYEC 108 главного корня, вторичных корней, корневых волосков и верхушки. Растения, которые появлялись из семян, покрытых Streptomyces WYEC 108, были более здоровыми, имели более длинные корни и большую плотность корневых волосков по сравнению с контрольными растениями, которые появлялись из семян, не покрытых WYEC 108. Эта разница была отчетливо связана с колонизацией корней биоконтролирующим агентом. Корни, колонизированные биоконтролирующим агентом, не имели каких-либо симптомов поражения корней. Streptomyces WYEC 108 показали отличную колонизацию корней в присутствии конкуренции со стороны природной микрофлоры ризосферы. Противогрибковая активность. В добавление к способности колонизировать корни растений и вырабатывать противогрибковые метаболиты наблюдалась также способность Streptomyces WYEC 108 лизировать клеточную стенку и ооспоры грибов. С помощью сканирующего электронного микроскопа было показано, что гифы Streptomyces WYEC 108 колонизировали поверхность гиф и ооспор гриба, включая гифы и ооспоры Pythium ultimum. Колонизированные гифы и ооспоры разрушились Streptomyces WYEC 108, наиболее вероятно, в результате экстрекции WYEC 108, экстрацеллюлярных ферментов, таких как хитиназы и целлюлазы. Показано, что Streptomyces WYEC 108 вырабатывает обе группы этих ферментов. Вероятно, Streptomyces WYES 108 вырабатывает также ряд других экстрацеллюлярных разрушающих ферментов. Пример VI. Включение Streptomyces WYEC 108 в доставочную среду. Композиция, удобная для длительного хранения жизнеспособных спор Streptomyces WYEC 108 и использования в сельскохозяйственной практике, была составлена следующим образом. 1-литровые колбы Эрленмейера, содержащие 500 мл среды YGM (pH 7,0-7,1) инокулировали 20 мл исходной культуры и инкубировали при встряхивании на 250 об/мин при 30oC в течение трех дней. После инкубации культуру собирали центрифугировали на 5000 об/мин. в течение 10 мин. Собранный материал ресуспендировали в 1600 мл 10% YGM и смешивали со стерильным раствором 8 г NH4Cl в 400 мл дистиллированной воды. Два литра смеси клеток и NH4Cl затем инкубировали в пластиковый контейнер, содержащий 4 кг стерильной доставочной среды, состоявшей из смеси песка, воды и кукурузной муки в соотношении 9:2:1 (вес/вес). Доставочную среду дважды стерилизовали (3 ч при 121oC) перед инокуляцией культуры. Эту смесь затем инкубировали в течение 10 - 14 дней при 25oC, чтобы довести до максимума содержание спор в смеси. Streptomyces WYEC 108 вырабатывали споры в течение 10 - 14 дней инкубации, в результате чего повышалось кое/г доставочной среды (до среднего уровня 108 - 109 кое/г доставочной среды (сухой вес)). Эту смесь затем хранили при 4oC вплоть до использования. Клетки и споры можно получать и на среде CYG вместо среды YGM. Как альтернативный способ собиранию клеток центрифугированием культуральные колбы (флаконы) можно также оставлять стоять до оседания бактериального мицелия и спор. Затем прозрачный надосадок сливают, а концентрированную суспензию мицелия и спор инокулируют непосредственно в доставочную среду. Когда применяется эта процедура собирания, нет необходимости добавлять к среде NH4Cl, поскольку бактериальная ростовая среда (YGM или CYG) является подходящим источником азота. Пример VII. Влияние Streptomyces WYEC 108 на прорастание и сырой вес продуктов лука/
Для определения влияния Streptomyces WYEC 108 на рост латука семена выращивали как на доставочной среде, содержащей Streptomyces WYEC 108, как описано в примере VI выше, так и на почве, простерилизованной паром. На каждую ростовую среду высевали по 30 семян (одно семя на 4 х 13,5- см горшок) и прорастание регистрировали спустя 21 день роста. Сырой вес определяли путем сбора надземных частей растений спустя 35 дней роста. Сырой вес выражали средними величинами. Результаты представлены в таблице VII. Данные табл. VII свидетельствуют о том, что, обработка семян латука Streptomyces WYEC 108 увеличивала как всхожесть семян, так и сырой вес проростков. Пример VIII. Применение Streptomyces WYEC 108 в доставочной среде на поле. Исследования по биологическому контролю in vivo выполнялись для определения эффективности Streptomyces WYEC 108 как биоконтролирующего агента при инкорпорации в доставочную среду, описанную выше. Streptomyces WYEC 108 был получен и инкорпорирован в доставочную среду, как описано выше в примере VII, при использовании Streptomyces WYEC 108, выращенного в течение трех дней на среде YGM. Исходная популяция Streptomyces WYEC 108 в доставочной среде была определена приблизительно в 1,0-1,2


Образование спор Streptomyces WYEC 108 в жидкой среде. Биоконтролирующие агенты должны сохранять жизнеспособность в течение длительных периодов времени, чтобы соответствовать нуждам перевозки и временному характеру сельскохозяйственных работ. Применение спор штамма WYEC 108 в большей степени, чем вегетативных клеток в композициях для биоконтроля, увеличивает срок хранения биоконтролирующей композиции, поскольку споры сохраняют жизнеспособность при неблагоприятных условиях и в течение длительных периодов времени. Обычно споры видов Streptomyces образуются только на твердых средах. Однако, как объясняется ниже, был обнаружен следующий способ получения этих спор в жидкой культуре. В двухлитровые колбы Эрленмейера, содержавшие по 200 мл среды YGM (pH 6,5), инокулировали 50 мл исходной культуры (полученной, как описано в примере II) и инкубировали при встряхивании на 250 об/мин при 30oC в течение 12-18 дней. За образованием спор следили путем просмотра культур под фазово-контрастным микроскопом (x 1000, окрашивание метиленовым синим). Споры собирали центрифугированием на 9000 об/мин в течение 10 мин. После этого споры ресуспендировали в 600 мл стерильной 10%-ной жидкой среды YGM и добавляли 400 мл стерильного раствора, содержавшего 8 г NH4Cl в дистиллированной воде (для получения конечной плотности спор 1,0 - 1,2

Стабильность композиции с альгинатным гелем. Мицелий Streptomyces WYEC 108 собирали центрифугированием на 5000 об/мин в течение 10 мин из 500 мл 3-дневной жидкой культуры YGM. Собранный мицелий ресуспендировали в 125 мл 10% YGM и добавляли 125 мл стерильного 5%-ного раствора альгината натрия до плотности культуры 1,0 - 1,2


Предпочтительные композиции доставочной среды, включающей Streptomyces WYEC 108. После изложения способов выделения штаммов актиномицетов, тестирования этих штаммов на их пригодность в качестве биоконтролирующих агентов, способов получения этих биоконтролирующих агентов в форме мицелия и спор, подходящей доставочной среды и в предпочтительном варианте Streptomyces WYEC 108 специалисту будет ясно, что настоящее изобретение можно модифицировать целым рядом способов, не отступая от идеи настоящего изобретения. Ниже приводятся примеры альтернативных вариантов осуществления настоящего изобретения вместе с описанием особенно предпочтительных вариантов осуществления. Оптимальные условия культивирования
Оптимальные условия для роста штамма WYEC 108 включают температуры между 20 и 30oC, значения pH между 5,5 и 7,5 и скорости перемешивания в ферментере между 200 и 300 об/мин. Streptomyces WYEC 108 обычно достигает максимальных выходов клеточной массы около 5,3 г сухого веса биомассы на литр в жидкой среде YGM при условиях культивирования 30oC, pH 6,5 и встряхивании на 250 об/мин, в течение 72 ч (до окончания log фазы). Время удвоения во время логарифмической фазы роста составляет приблизительно 10 ч. 72-часовое время инкубации может быть значительно сокращено при использовании более высоких уровней инокуляции клеток в log фазе. Иначе споры можно получать на твердой агаровой среде, такой как агар для спорообразования. Эти споры можно собирать непосредственным соскабливанием в подходящую жидкую среду, такую как 10% YGM, и затем непосредственно вводить в доставочную среду. Этот подход избавляет от необходимости выращивания культуры в жидкой среде и, таким образом, сокращает процесс получения продукта. Предпочтительная и альтернативная доставочные среды
Streptomyces WYEC 108 можно инкорпорировать в доставочную среду для использования в сельском хозяйстве и садоводстве. Пример VI описывает одну рецептуру доставочной среды, которая включает песок/воду/кукурузную муку в соотношении 9 : 2 : 1 (в/в). Специалист должен понять, что рецептура доставочной среды может диктоваться конкретным вариантом применения, для которого предназначен биоконтролирующий агент. Например, к доставочной среде можно прибавлять различные органические и неорганические наполнители, такие как глина, вермикулит, пшеничные отруби, кукурузные кочерыжки или хитин. Соотношение компонентов в доставочной среде определяется на основании требуемых текстуры и физических свойств. Например, могут быть важными такие свойства, как способность удерживать влагу, легкий вес для удобства применения и транспортировки, полезность для обеспечения пространства для роста и распространения мицелия и корней растений. Альтернативно можно добавлять вегетативный мицелий или споры Streptomyces WYEC 108 к альгинатной суспензии для получения гранул этого микроорганизма, заключенного в альгинат. Способы получения альгинатных гранул известны специалистам и описываются в патенте США N 4668512 и др. В эти гранулы также можно инкорпорировать другие ингредиенты, такие как удобрения. В предпочтительном варианте осуществления изобретения, авторы определили, что особенно удобна доставочная среда, включающая торфяной мох/песок/кукурузную муку в соотношении 1 : 3,5 : 1 (вес). Это соотношение создает подходящую плотность и влагоудерживающую способность для использования этого продукта в сельском хозяйстве и садоводстве. Однако, как было отмечено выше, другие соотношения этих компонентов и других компонентов также являются приемлемыми для доставочной среды. Например, эффективная альтернативная доставочная среда включает торфяной мох (620 г)/песок (3380 г)/кукурузную муку (270 г)/хитин (10 г). В одном варианте осуществления изобретения приблизительно 1,6 л собранного культурального бульона (клетки в log-фазе, например приблизительно 72 ч культура), содержавшего мицелий Streptomyces WYEC 108, выращенный на бульоне YGM, как описано выше, смешивали с 400 мл стерильного раствора NH4Cl (содержащего 8 г NH4Cl в 400 мл дистиллированной воды) и инокулировали в пластиковые контейнеры, содержавшие 4 кг стерильной доставочной среды, состоявшей из торфяного мха, песка и кукурузной муки. Доставочную среду дважды стерилизовали (3 ч при 121oC) перед инокуляцией Streptomyces WYEC 108. Инокулированные контейнеры инкубировали при 30oC в течение 10 - 14 дней для максимального спорообразования. Контейнеры затем хранили при 4oC вплоть до использования. Использование NH4Cl в доставочной среде создает источник азота для прорастающих спор Streptomyces WYEC 108. Специалисту будет ясно, что для этой цели можно использовать и другие источники азота помимо NH4Cl. Например, и как описано в настоящем документе, когда споры ресуспендируют в ростовой среде для бактерий (такой как 10% YGM) перед инкорпорацией в доставочную среду, добавление этого источника азота уже не является необходимым. В предпочтительных вариантах осуществления настоящего изобретения доставочная среда включает доставочное количество источника азота. Специалисту будет ясно, что "достаточное количество" источника азота можно определить по эффекту на прорастание повышенных или пониженных количеств определенного источника азота или по эффекту смены источника азота. Достаточное количество источника азота представляет такое количество определенного источника азота, которое облегчает прорастание спор Streptomyces WYEC 108. В альтернативном варианте осуществления изобретения, как описано в примере XI, споры Streptomyces WYEC 108 получали в жидкой среде и инкорпорируют непосредственно в предпочтительную доставочную среду, которую затем хранят при 4oC. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения Streptomyces WYEC 108 добавляют к доставочной среде до конечной концентрации по меньшей мере 1



Подробное описание рецептуры доставочной среды, включающей Streptomyces WYEC 108. Процедура приготовления предпочтительной композиции доставочной среды, включающей Streptomyces WYEC 108, была в основном следующей. Все процедуры, описанные ниже, производились с помощью стандартной асептической методики (например, в камере с ламинарным потоком воздуха, простерилизованной УФ-лучами), чтобы гарантировать асептические условия вплоть до вскрытия упакованных пакетов потребителями. Получение клеток. 1) Суспендировали споры со скошенного агара CYD со Streptomyces WYEC 108 в 10 мл стерильного бульона YGM или CYD (pH 6,5). Эту суспензию использовали для инокуляции в культуральные флаконы. 2) Инокулировали шесть 250-мл флаконов, содержавших 100 мл YGM (pH 6,5). Использовали 10 мл суспензии спор на флакон в качестве инокулюма. После инокуляции флаконы инкубировали при встряхивании на 200 об/мин и 30oC в течение приблизительно 36 ч. 3) Инокулировали шесть 2-литровых флаконов, содержавших 1,1 л бульона YGM (pH 6,5) мицелиальным инокулюмом, приготовленным на предыдущем этапе (100 мл инокулюма на флакон). После инокуляции флакона инкубировали при встряхивании на 200 об/мин и 30oC в течение приблизительно 24 - 48 ч или больше (до 4 дней). Эта становилось инокулюмом для ферментера. Ферментация. Приблизительно 7,2 л исходной культуры, приготовленной, как описано выше, инокулировали в ферментер, содержавший 40 л стерильного бульона YGM (pH 6,5) (= 15% инокулюма по объему; подход состоял в инокуляции настолько высокой плотности клеточной суспензии, насколько это оправдано практикой). В ферментере производилось перемешивание (200 об/мин) при 30oC в течение приблизительно 72 ч (почти до окончания log фазы). Сбор культуры из ферментера. 1) Культуральный бульон из ферментера, содержавший клетки WYEC 108, (приблизительно после 72 ч инкубации) собирали в асептических условиях в стерильные 20-литровые пластиковые бутыли. 2) К собранному культуральному бульону, содержавшему клетки WYEC 108, добавляли стерильный раствор H4Cl (использовали 16 г NH4Cl, растворенных в 800 мл дистиллированой воды, на 3,2 л собранного культурального бульона; предварительно раствор стерилизовался автоклавированием). Получившийся 1,2 л объем содержавшей NH4Cl клеточной суспензии затем тщательно перемешивали путем встряхивания бутыли до ее инокуляции в предварительно приготовленную доставочную среду. Приготовление доставочной среды. 1) Каждый компонент доставочной среды по отдельности тщательно отмеряли и добавляли в кювету большого размера, которую можно было подвергать стерилизации, или в другой подходящий контейнер. Комбинированную смесь определяли как доставочную среду. Последняя состояла из торфяного мха, песка и кукурузной муки (540 г : 2700 г : 540 г; 1:3,5:1 (вес./вес.)). 2) Доставочную среду тщательно перемешивали и покрывали прочной алюминиевой фольгой или хлопковой ватой, а затем стерилизовали дважды (90 мин за один раз при 121oC с 12-часовым интервалом). 3) Доставочную среду охлаждали до комнатной температуры после второй стерилизации и перед инокуляцией собранного культурального бульона, содержавшего штамм WYEC 108 и раствор NH4Cl (приготовленный, как описано выше). Инкорпорация Streptomyces WYEC 108 в доставочную среду для создания композиции из торфяного мха, песка, воды, кукурузной муки и NH4Cl. 1) Приблизительно 0,5 л собранного культурального бульона, содержавшего штамм WYEC 108 и раствор NH4Cl (приготовленные, как описано выше) аккуратно инокулировали в каждый из необходимого количества предварительно простерилизованных пластиковых контейнеров, содержавших 3,78 кг доставочной среды. 2) Инокулированные контейнеры затем инкубировали при 30oC в течение 10 - 14 дней (инкубация может быть оптимальной до 20 дней), после чего их можно было хранить при 4oC вплоть до использования (композиция стабильна в течение месяцев). Упаковка и транспортировка. 1) Приготовленную композицию, содержащую Streptomyces WYEC 108, асептически переносили в стерильные трехслойные пластиковые пакеты, используя маленькую простерилизованную лопатку или эквивалентный инструмент, предпочтительно в камере с ламинарным потоком воздуха со стерилизацией УФ-лучами. 2) Упакованные пакеты затем завязывали и помещали в 1,5 фт3 ящики для транспортировки. Каждый ящик затем запечатывали прочной лентой. Пример XII
Включение композиции, содержавшей Streptomyces WYEC 108 в рассадочные грядки. Композицию, содержавшую биоконтролирующий агент Streptomyces WYEC 108 и доставочную среду, описанную в примере XII, смешивали с почвой для рассадочных грядок или смесь для рассадочных горшков до конечной концентрации Streptomyces


1. ATCC Catalogue of Bacteria and Bacteriophages, 17th Edition, 1989. Amterican Type Culture Collection, Rockville, MD. 2. Locci, R. 1989. "Streptomyces and Related Genera", in Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Williams and Wilkens, Baltimore, MD. 4:2451-2492. 3. Filnow, A. B. and J.L Lockwood. 1985. Evaluation of several actinomycetes and the fungus Hypochytrium catenoides as biocontrol agents of Phylophthora root rot of soybean. Plant Disease 69:1033-1036. 4. Ingram, D. M. and R. J. Cook. 1990. Pathogenicity of four Pythium species to wheat, barley, peas, and lentils. Plant Pathology 39:110-117. 5. Kraft, J. M. and D.W. Burke. 1971. Pythium ultimum as a pathogen of beans and peas in Washington. Plant Dis. Rep. 55:1056-1060. 6. Lynch, J. M. , R. D. Lumsden, P.T. Atkey, and M. A. Ousley. 1992. Prospects for control of Pythium damping-off of lettuce with Trichoderma, Gliocladium, and Enterobacier 15 spp. Biol Fertil. Soils 12:95-99. 7. Lynch, J. M. , K. L. Wilson, M. A. Ousley, and J. M. Whipps. 1991. Response of lettuce to Trichoderma treatment. Lett. Appl. Microbiol. 12: 59-61. 8. Miller, J. J. E. Liljeroth, G. Henken, and J. A. van Veen. 1990. Fluctuations in the fluorescent pseudomonad and actinomycete populations of rhizosphere and rhizoplane during the growth of spring wheat. Can. J. Microbiol. 36:254-258. 9. Pridham, T.G. and D. Gottlieb. 1948. The utilization of carbon compounds by some actinomycetales as an aid for species determination. J. Bacteriol. 56:107-114. 10. Reddi, G. S., and A. S. Rao. 1971. Antagonism of soil actinomycetes to some soil borne plant pathogenic fungi. Indian Phytopathol. 24: 649-657. 11. Stanghellini, M.E. and J.G. Hancock. 1970. A Quantitative Method for the Isolation of Pythium ultimum from Soil. Phytopathology. 60:551- 552. 12. Stasz, Т.Е., G.E. Harman and G.A. Marx. 1980. Time and site of infection of resistant and susceptible germinating pea seeds by Pythium ultimum. Phytopathology. 70:730-733. 13. Trapero-Casas, A. , W.J. Kaiser and D.M. Ingram. 1990. Control of Pythium seed rot and preemergence damping-off of chickpea in the U.S. pacific northwest and Spain. Plant Dis. 74:563-569. 14. Westerlund. F. V..Jr., R.N. Campbell and K.A. Kimble. 1974. Fungal root rots and wilt of chickpea in California. Phytopathology 64:432-436.
Формула изобретения
РИСУНКИ
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3, Рисунок 4, Рисунок 5, Рисунок 6, Рисунок 7, Рисунок 8, Рисунок 9, Рисунок 10, Рисунок 11, Рисунок 12, Рисунок 13, Рисунок 14, Рисунок 15, Рисунок 16, Рисунок 17, Рисунок 18