Олигонуклеотиды, фармацевтическая композиция
Изобретение относится к олигонуклеотидам и их производным для подавления экспрессии изопренилпротеинтрансфераз, фармацевтическим композициям, содержащим такие соединения, и к использованию таких композиций олигонуклеотидов для лечения или терапии заболеваний человека или животных, вызванных ненормальной и/или нерегулируемой пролиферацией. Олигонуклеотиды имеют формулу (I): P - O-R (I), где Р либо отсутствует, либо представляет собой последовательность из одного или более оснований, выбранных из А (аденин), Т/(тимин), С (цитозин) или G (гуанин); О является последовательностью, выбранной из: SEQIDN1: AGAAGCCATG AT; SEQIDN2: GGACGTGACT GT; SEQIDN3: AAGGAGTAGC AG; SEQIDN4: CAGGCAGTAG CA; SEQIDN5: CCCGTCGTCC AT; SEQIDN6: CTGTCCCTGT AC; SEQIDN7: ACTTCTCTCT CC; SEQIDN8: ACTTGGTCCT AA; SEQIDN9: GCCATCATTC TG; SEQIDN10: GATCTGGACC AC; SEQIDN11: CTCAATAGCA TC; SEQIDN12: GTTTTTGGGG TG; SEQIDN13: TCTCACATCC TC; SEQIDN14: TTGTAAGAAC TG; SEQIDN15: GAAGTGCTTC TC; SEQIDN16: GCCTCTTTC AG; SEQIDN17: GGCATCTGTC AG; SEQIDN18: CGGCTGGCAT CC; SEQIDN19: GAACTGACAC AC; SEQIDN20: ACGATCACAT CA; SEQIDN21: ATCAACATGC AG; SEQIDN22: CTGCATATCG AC; SEQIDN23: CAGTGCACCA GC; SEQIDN24: CTGCAGCCTC GG; SEQIDN25: ACTCTGGA CC; SEQIDN26: CAAGAATCCT CG; SEQIDN27: ACATCTGCTC TG; SEQIDN28: TCTGTACTCG TC; SEQIDN29: CTACAGTACA GC; SEQIDN30: CCCGTCGTCC ATAGG; SEQIDN31: CCCGTCGTCC ATAGGGGA; SEQIDN32: CCCGTCGTCC ATAGGGGAC GC; SEQIDN33: GGACGTGACT GTTTC; SEQIDN34: GGACGTGACT GTTTCCAC; SEQIDN35: GGACGTGACT GTTTCCACTG; SEQIDN36: GGACGTGACT GTTTCCACTG AGTC, R либо отсутствует, либо представляет собой последовательность из одного или более оснований, выбранных А, Т, С или G. Фармацевтическая композиция, обладающая антипролиферативным действием, содержащая в качестве активного ингредиента эффективное количество, по крайней мере, одного олигонуклеотида формулы (I) в смеси с фармацевтически приемлемым разбавителем и/или носителем, пригодным для выбранного способа введения. 2 с. и 12 з.п.ф-лы, 9 табл.
Изобретение относится к олигонуклеотидам и их производным, которые подавляют экспрессию изопренилпротеинтарнофераз, терапевтическим композициям, содержащим такие соединения, и использованию таких композиций олигонуклеотидов для лечения или терапии заболеваний человека или животных, вызванных ненормальной и/или нерегулируемой клеточной пролиферацией.
Любой живой организм, будь он одноклеточным или многоклеточным, характеризуется способностью к размножению, феноменом, требующим репликации материала наследственности (ДНК и т.д.) и одинакового распределения реплицированной ДНК между двумя "дочерними" клетками. Существует большое число очень разных молекул с митогенной активностью, которые действуют "специфичным для клетки" образом. "Сигнальные" молекулы или факторы роста являются типами полипептидов, которые в очень низких количествах и после взаимодействия с клетками-мишенями могут вызывать каскад событий, которые завершают репликацию ДНК и митоз. Факторы роста действуют на клеточный цикл не непосредственно, а путем взаимодействия с серией трансмембранных рецепторов, расположенных на плазматической мембране мишеневых клеток, и их активации. Этот механизм запускает цепную реакцию в клетке, которая приводит к митозу. Активируемые внутриклеточные события могут меняться от одного типа клеток к другому для одних и тех же рецепторов. Одна из первых стадий связывания фактора роста с его рецептором состоит и в активации киназного белка и фосфорилировании белков. Один из белков, образующих это звено сигнальной трансдукции, является белком ras, белком в 21 к-дальтон, модифицированным с помощью механизма пренилирования. Пренилирование является посттрансляционным изменением, которое включает ковалентное связывание изопренильных группировок с цистеином многочисленных белков. Таким образом, изопренилирование может быть переносом фарнезильной группировки или геранилгеранильной группировки к мишеневым белкам. Эта модификация позволяет некоторым белкам связаться с местом действия на мембране. Таким образом, одним из результатов подавления этого пренилирования является предотвращение трансдукции экстраклеточных сигналов к ядру и, следовательно, клеточной пролиферации. К настоящему времени определены характеристики трех типов ферментов, которые катализируют эту модификацию: фарнезилпротеинтрансферазы, геранилгеранилпротеинтрансферазы типа 1 и геранилгеранилпротеинтрансферазы типа 2. Эти ферменты распознают консенсусные последовательности, расположенные на C-концах белков. Одним из последствий блокирования синтеза этих ферментов является блокада основных путей сигнальной передачи, которая приводит к пролиферации клеток. Большинство классических активных ингредиентов взаимодействует с белками, продуктом трансляции генетической информации и подавляют их функции. Данное изобретение направлено на современный терапевтический подход: антисмысловую стратегию. Указанный подход предполагает селективную модуляцию экспрессии гена путем селективного соединения нуклеотидной цепи (олигонуклеотидов) с комплементарной им последовательностью на матричной или предматричной РНК или ДНК и, следовательно, подавляется синтез соответствующего белка. Используемые молекулы взаимодействуют непосредственно с системой генетической информации. Олигонуклеотиды, комплементарные продуктам транскрипции, называются "антисмысловыми" олигонуклеотидами. Олигонуклеотиды, имеющие ту же самую последовательность, что и продукты транскрипции, называются "смысловыми" олигонуклеотидами. Первоначально эти соединения были рационально предназначены для подавления образования продукта гена путем удаления соответствующей матричной РНК с помощью гидролиза РНК-азой H. Вскоре выяснилось, что механизм действия этих антисмысловых олигонуклеотидов не так прост. Эти олигонуклеотиды могли взаимодействовать с разным числом клеточных мишеней, не являющихся нуклеиновыми кислотами. Эти олигонуклеотиды могли взаимодействовать с геном с образованием структур с тройной спиралью и подавлением образования продуктов транскрипции. Олигонуклеотиды могли взаимодействовать с интронэкзонными соединениями предматричной РНК, мешая таким образом правильному сплайсингу продукта транскрипции. Олигонуклеотиды могли гибридизоваться с мРНК в цитоплазме путем образования дуплекса РНК-ДНК, который быстро разрушается ферментом РНК-азой H или препятствуя движению рибосомного комплекса по мРНК, блокируя, таким образом, трансляцию. Олигонуклеотиды, особенно модифицированные олигонуклеотиды, могли взаимодействовать с рядом клеточных компонентов, таких как белки. Эти взаимодействия могли быть специфичными для последовательности (например, факторы транскрипции) или могли быть неспецифичными для последовательности (например, факторы роста). Таким образом, олигонуклеотиды (ПОСЛ ИД N 1-36) могут вызывать остановку пролиферации путем любого одного или сочетания вышеназванных механизмов. Изобретение, в частности, направлено на применение антисмысловых олигонуклеотидов для блокирования синтеза ферментов, как указано выше. Это предполагает их использование в качестве антипролиферативных средств пpи сердечно-сосудистых заболеваниях, в онкологии, дерматологии, при некоторых вирусных инфекциях и при любых патологических состояниях, связанных с клеточной пролиферацией. При антисмысловой методологии могут использоваться антисмысловые олигонуклеотиды или антисмысловые РНК. Методология с антисмысловыми олигонуклеотидами отличается от методологии с антисмысловыми РНК. При последней сегмент ДНК гена встраивается в векторную ДНК в противоположной ориентации нормальной смысловой и, таким образом, во время транскрипции указанного вектора одна из цепей его ДНК реплицируется в РНК. Вставка фрагмента гена с обратной последовательностью приводит к синтезу in situ РНК, которая комплементарна нормальной мРНК, синтезируемой самой клеткой. Эта РНК, называемая антисмысловой РНК, может гибридизоваться с экспрессируемой в норме мРНК и, таким образом, подавлять трансляцию мишеневого белка. Такой метод использовался Prendergast et al. (Cell Growth and differenciation 4,707-713, September 93) для оценки роли фарнезилпротеинтрансферазы, кДНК для






AGAAGCCATG AT
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 2
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N2
GGACGTGACT GT
(2) Информация по ПОСЛ ИД N3
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(С) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 3
AAGGACTAGC AG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 4
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число цепей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(IX) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 4
CAGGCAGTAG CA
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 5
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 5
CCCGTCGTCC AT
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 6
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 6
CTGTCCCTGT AC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 7
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(IX) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 7
ACTTCTCTCT CC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 8
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 8
ACTTGGTCCT AA
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 9
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 9
GCCATCATTC TG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 10
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) антисмысловая: да
(XI) описание последовательности: ПОСЛ ИД N 10
GATCTGGACC AC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 11
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 11
CTCAATAGCA TC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 12
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 12
GTTTTTGGGG TG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 13
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(IX) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 13
TCTCACATCC TC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 14
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 14
TTGTAAGAAC TG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 15
(1) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 15
GAAGTGCTTC TC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 16
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 16
GCCTCTTTC AG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 17
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 17
GGCATCTGTC AG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 18
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 18
CGGCTGGCAT CC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 19
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 19
GAACTGACAC AC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 20
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 20
ACGATCACAT CA
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 21
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 21
ATCAACATGC AG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 22
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 22
CTGCATATCG AC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 23
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 23
CAGTGCACCA GC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 24
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 24
CTGCAGCCTC GG
(2)Информация по ПОСЛ ИД N 25
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 25
ACTCTCTGGA CC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 26
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 26
CAAGAATCCT CG
(2)Информация по ПОСЛ ИД N 27
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 27
ACATCTGCTC TG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 28
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 28
TCTGTACTCG TC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 29
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 12 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 29
CTACAGTACA GC
(2)Информация по ПОСЛ ИД N 30
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 15 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 30
CCCGTCGTCC ATAGG
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 31
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 18 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 31
CCCGTCGTCC ATAGGGGA
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 32
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 21 пара оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 32
CCCGTCGTCC ATAGGGGACG C
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 33
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 15 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 33
GGACGTGACT GTTTC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 34
(A) длина: 18 пар оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 34
GGACGTGACT GTTTCCAC
(2) Информация по ПОСЛ ИД N 35
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 21 пара оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 35
GGACGTGACT GTTTCCACTG A
(2)Информация по ПОСЛ ИД N 36
(I) Характеристики последовательности:
(A) длина: 24 пары оснований
(B) тип: нуклеотидная
(C) число нитей: одинарная
(D) топология: линейная
(IV) Антисмысловая: да
(XI) Описание последовательности: ПОСЛ ИД N 36
GGACGTGACT GTTTCCACTG AGTC
Формула изобретения
P-O-R,
где P либо отсутствует, либо представляет собой последовательность из одного или более оснований, выбранных из A (аденин), T (тимин), C (цитозин) или G (гуанин);
О является последовательностью, выбранной из

R либо отсутствует, либо представляет собой последовательность из одного или более оснований, выбранных A, T, C или G. 2. Олигонуклеотид по п.1, отличающийся тем, что гибридизируется с геном илипродуктамитранскрипциидлясубъединиц



8. Олигонуклеотид по любому из предшествующих пунктов, отличающийся тем, что имеет модифицированный скелет. 9. Олигонуклеотид по п.8, отличающийся тем, что по крайней мере одно из нуклеотидных оснований модифицировано. 10. Олигонуклеотид по п.9, отличающийся тем, что модифицированное нуклеотидное основание имеет

РИСУНКИ
Рисунок 1, Рисунок 2