Способ получения сериновой протеазы, штамм щелочефильных bacillus-продуцент сериновой протеазы
Использование: микробиологический способ получения фермента, а именно получение сериновой протеазы рекомбинантной технологией. Сущность изобретения: способ получения сериновой протеазы предполагает культивирование штамма щелочефильных Bacillus РВ 92, трансформированных рекомбинантной плазмидой ДНК pMAX 4, выделение и очистку целевого продукта. Трансформацию штамма осуществляют путем обработки штамма лизоцимом в щелочной среде при 20 - 37°С, отделения образовавшихся протопластов от лизоцима, объединения протопластов с рекомбинантной плазмидной ДНК при той же температуре в присутствии реагента для смещения, регенерации клеток штаммов и выращивания регенерированных клеток в селективных условиях. 1 табл., 2 ил.
Изобретение относится к получению сериновой протеазы Bacillus c применением технологии рекомбинантных ДНК.
Бактериальные сериновые протеазы могут быть получены из многих прокариотических организмов, включая грамотрицательные организмы, такие как виды Serratia или Pseudomonas, и грамположительные бактерии, такие как виды Micrococcus и Bacillus. В группу промышленно важных сериновых протеаз, представляющих исключительный интерес, входят те протеазы, которые имеют высокую активность в щелочных средах. В то время как промышленные сериновые протеазы вырабатываются различными видами, включая B. subtilis, B. licheniformis, B. amyloliquefaciens, B. alcalophilus и другие виды Bacillus, высокощелочные протеазы в основном вырабатываются штаммами Bacillus, которые способны к росту при щелочном рН. Примером такой бациллы служит Bacillus novo species PB 92. Существует значительный интерес к разработке штаммов бацилл, способных вырабатывать протеолитические ферменты с большим выходом, в частности высокощелочные протеазы. Были успешно клонированы гены, кодирующие сериновую или щелочную протеазу B. subtilis (Wong et. al., Proc. Natl Acad. Sci USA 81, 1984, 1184), B. licheniformis (Jacols et. al. Nucleic Acids Res. 13, 1985, 8913) и B. amyloliquefaciens (wells et. al. Nucleic Acids Res 13, 1985, 8913) и B. amyloliquefaciens (wells et. al. Nucleic Acids Res, 11, 1983, 7911). Производство промышленных сериновых протеаз в различных видах Bacillus известно из патентов США NN 3674643; 3723250 и 4480043. Производство высокощелочного протеолитического фермента в штаммах Bacillus, способных к росту при щелочном рН, описано, например, в патентах США NN 3723250; Re 30602 и 4480037. Удобный вектор для трансформации клетки Bacillus включает структурный ген, кодирующий высокощелочную протеазу, получаемый щелочефильной Bacillus, содержащей контролирующие районы, такие как последовательность промотора, последовательность, образующая участок связывания с рибосомами, и последовательности, контролирующие терминацию транскрипции и трансляции гена щелочной протеазы, причем перечисленные контролирующие участки являются функциональными в хозяйской клетке щелочефильной Bacillus. Кроме того, вектор может содержать маркерный ген, например, для придания устойчивости к антибиотику, к которому хозяйский штамм чувствителен (особый интерес представляет устойчивость к неомицину), и origin репликации, который способен автономно реплицироваться в хозяйской клетке. Origin репликации может быть таким, который имеет мутацию, делающую его функционирование в хозяйской клетке температурочувствительным, таким образом обеспечивая селекцию на хромосомальное встраивание. Для производства высокощелочной протеазы предпочтительной последовательностью ДНК для использования в трансформации штаммов Bacillus, которые продуцируют сериновую протеазу, является последовательность, полученная из Bacillus novospecies PB 92. Аминокислотная последовательность сериновой протеазы, кодируемая указанной последовательностью ДНК, следующая: 15 H2N-A-Q-S-V-P-W-G-I-S-R-V-Q-A-P-A-A-H-N-R-G-L-T-G-S-G-V-K-V-A- V-L-D-T-G-I-S-T-H-P-D-L-N-I-R-G-G-A-S-F-V-P-G-E-P-S-T-Q-D-G-N- G-H-G-T-H-V-A-G-T-I-A-A-L-N-N-S-I-G-V-L-G-V-A-P-N-A-E-L-Y-A-V- K-V-L-G-A-S-G-S-G-S-V-S-S-I-A-Q-G-L-E-W-A-G-N-N-G-M-H-V-A-N-L- S-L-G-S-P-S-P-S-A-T-L-E-Q-A-V-N-S-A-T-S-R-G-V-L-V-V-A-A-S-G-N- 20 S-G-A-G-S-I-S-Y-P-A-R-Y-A-N-A-M-A-V-G-A-T-D-Q-N-N-N-R-A-S-F-S- Q-Y-G-A-G-L-D-I-V-A-P-G-V-N-V-Q-S-T-Y-P-G-S-T-Y-A-S-L-N-G-T-S- M-A-T-P-H-V-A-G-A-A-A-L-V-K-Q-K-N-P-S-W-S-N-V-Q-I-R-N-H-L-K-N- T-A-T-S-L-G-S-T-N-L-Y-G-S-G-L-V-N-A-E-A-A-T-R-COOH. Хотя предпочтительным штаммов для обеспечения гена протеазы является вид Bacillus PB 92, такая же сериновая протеаза может быть получена из других щелочефильных бацилл. Гены протеаз - гомологичные по крайней мере на 70% и предпочтительно свыше 80% к гену Bacillus PB 92. Желательно, чтобы продукт эксперсии секретировался. Так как щелочная протеаза секретируется, могут быть использованы секреционные лидерные сигналы и сигналы процессинга дикого типа. Кроме того, может быть получен слитый ген путем придания 5' -последовательности структурному гену, кодирующему секреторный лидерный сигнал и сигнал процессинга. Характерные гетерологичные секреторные лидерные последовательности включают секреторные лидерные последовательности генов амилазы и протеазы Bacillus. В зависимости от того, желательно ли встраивание структурального гена в хромосому хозяйского штамма либо поддержание его во внехромосомальном элементе, репликационная система Bacillus может быть включена или нет. С целью встраивания участки гомологии плазмидной конструкции с геномом Bacillus могут быть использованы для увеличения вероятности рекомбинаций. Более того, включение в плазмидную конструкцию температурочувствительного origin репликации позволяет проводить селекцию по хромосомальному встраиванию. Для увеличения экспрессии структурного гена в хозяйскую клетку может быть вставлено более одной копии структурного гена. Стабильная амплификация структурного гена может быть получена встраиванием по крайней мере одной добавочной копии структурного гена с геном хозяйской клетки и отбором трансформантов, в которых копии структурного гена разделены эндогенными хромосомальными последовательностями. Конструкции ДНК и способы для прокариотических систем известны из заявки N ЕР-А-87200356. В качестве хозяина для трансформации может быть использован любой штамм Bacillus, однако при выборе подходящего штамма учитываются факторы, которые могут улучшить продукцию высокощелочных протеаз. Продукция может быть улучшена различными путями, включая хозяина, в котором снижена деградация желаемого продукта, узнавание регуляторных сигналов, облегчение секреции и т. д. Таким образом, хотя предпочтительным хозяином Bacillus является продуцент высокощелочной протеазы, в качестве хозяина также может быть использован мутант, который сам по себе не вырабатывает высокощелочную протеазу. Бациллы, продуцирующие высокощелочную протеазу, таксономически недостаточно классифицированы и их обычно относят к щелочефильным штаммам Bacillus. Примеры штаммов Bacillus, способных расти при щелочном рН, известны из патентов США NN 3723250, Re 30602 и 4480037. Примером предпочтительного хозяйского штамма щелочефильного Bacillus является штамм Bacillus novo species PB 92, раскрытый наряду с другими в патенте США N Re 30602. Промышленные штаммы щелочефильных Bacillus могут также быть использованы в качестве хозяйских клеток. Для промышленных штаммов Bacillus характерна устойчивость к генетическому обмену, такому как фаговая инфекция или трансформация. Эти штаммы стабильны и трансформанты могут быть или не быть способными к образованию cпор. Они обычно фототрофы и модифицированы для обеспечения высоких выходов эндогенных белковых продуктов, таких как альфа-амилаза и различные протеазы. Выход эндогенного белкового продукта, полученный в процессе промышленного производства, может доходить по крайней мере до 5 г/л/0,5% ( объем/вес ). Промышленные штаммы также секретируют ДНК-азы, которые приводят к деградации ДНК в среде, обеспечивая защиту от генетического обмена. Трансформация щелочефильных штаммов Bacillus преимущественно включает использование протопластов упомянутых штаммов. Однако обычный способ трансформации протопласта не работает для щелочефильных штаммов Bacillus. Следовательно, должны быть разработаны дополнительные способы. Для щелочефильных бацилл образование и регенерация протопластов может происходить при высоком рН, предпочтительно около рН 8. Протопласты могут быть приготовлены ресуспендированием клеток в щелочной буферной среде (АНМ - alkaline holding medium) pH 7,8-8,5 c последующей инкубацией в течение 30-80 мин при 37оС. В качестве примера АНМ см. пример 5. Полученные протопласты затем промываются для удаления лизоцима, затем ресуспендируются в АНМ. Далее в присутствии подходящего реагента для слияния, плазмидная конструкция и протопласт щелочефильного хозяина Bacillus объединяются. Хотя может быть использован любой реагент для слипания, который обеспечивает желаемую эффективность, обнаружено, что полиэтиленгликоль молекул веса 1000-8000 в значительной мере обеспечивает высокую эффективность слияния. Протопласты, приготовленные из акцепторного штамма Bacillus, смешиваются с плазмидной конструкцией в течение не более 5 мин, желательно не дольше 2 мин в присутствии полиэтиленгликоля. Смесь реагентов для слияния затем меняется обычной питательной средой, в которой клетки инкубируются в течение до 5 ч, предпочтительно 2-3 ч, перед переносом на регенерирующие чашки. Регенерирующие чашки содержат антибиотик, такой как неомицин, для отбора трансформантов. Клоны с эписомальным поддерживанием конструкции ДНК могут быть идентифицированы путем обнаружения эксперссии высокощелочной сериновой протеазы. Для идентификации тех клонов, которые содержат экспрессирующую конструкцию в виде участка, встроенного в их хромосомы, клоны, которые получаются, скринируются путем выделения суммарной клеточной ДНК и отбора клонов, в которых может быть обнаружена свободная плазмидная ДНК, но маркерный ген плазмиды экспрессируется. Эти клоны затем можно скринировать подходящими способами для обнаружения экспрессии высокощелочной сериновой протеазы. Различные методы обнаружения, включая использования специфических антител, ДНК- или РНК-гибридизацию, образование ферментного продукта или использование ферментного субстрата могут быть использованы для скринирования клонов с целью обнаружения присутствия экспрессирующей конструкции и экспрессии интересующего структурного гена, а именно производства протеазы. Производимая протеаза может быть охарактеризована биохимически, например, определением молекулярного веса протеазы с помощью электрофореза в SDS-полиакриламидном геле, электрофореза в гис-тидин-MOPS геле и определением кинетических параметров Km и Vmax, определяемых на синтетическом субстрате suecinyl-alanyl-L-alanyl-L-prolyl-L-phenylalanyl-p-nitro-analide. Хозяин Bacillus, содержащий экспрессирующую конструкцию, включенную эписомально или хромосомально, затем выращивается на питательной среде в условиях, благоприятствующих синтезу фермента. Питательная среда обычно включает средства для поддержания плазмиды, такие как присутствие антибиотика, к которому чувствителен нетрансформированный хозяин. Ферментация может продолжаться пока не истощится бульон. Там, где продукт секретируется, он может быть выделен из бульона удобным способом, например экстракцией, хроматографией, электрофорезом или т.п. Там, где продукт остается в цитоплазме, клетки могут быть собраны центрифугированием, фильтрацией и т.д., лизированы механическим перетированием, детергентом, лизоцимом или другими методами и продукт может быть выделен, как описано ранее. Когда нетрансформированная хозяйская клетка является продуцентом высокощелочной протеазы, посредством представленного метода могут быть достигнуты сильно увеличенные выходы высокощелочной сериновой протеазы, обычно по крайней мере 120% по сравнению с выходом в нетрансформированной хозяйской клетке с единственной внехромосомной копией гена. На фиг.1 показаны результаты гистидин/MOPS гельэлектрофореза, проведенного с суспернатантами культур B. subtilis DB104, содержащими соответственно pUB110 и рМ 58 в сравнении с некоторыми субтилизации: 1 дорожка: субтилизин Carlsberg; 2 дорожка: протеаза Bacillus PB 92; 3 дорожка: субтилизин Bacillus subtilis; 4 дорожка: Bacillus subtilis ДВ 104 (рМ 58); 5 дорожка: Bacillus subtilis ДВ 104 (рИВ 110); на фиг. 2 - рестрикционная карта плазмиды рМ 58: в верхней части показана стратегия секвенирования. Сплошные линии со стрелками представляют фрагменты, клонированные в векторах mp 10, mp 11 и mp 13 фага М 13, в нижней части - стратегия сиквенирования с использованием 10 олигонуклеитидов, локализованных через равные промежутки на гене протеазы. Нуклеитидная последовательность кодирующей цепи, соотнесенная с аминокислотной последовательностью сериновой протеазы Bacillus PB 92, показана ниже. Также показаны промоторы (Р1Р2), сайт связывания рибосом (rbs) и районы терминации (term). последовательности ДНК. Пронумерованные сплошные линии представляют место размещения десяти олигонуклеитидов, использованных для секвенирования (см.табл.1). Изобретение иллюстрируется следующими примерами. П р и м е р 1. Приготовление библиотеки геномной ДНК из щелочефильного нового вида Bacillus PB 92 и выделение гена сериновой протеазы. Громосомальная ДНК, выделенная из Bacillus novo sp. РВ 92 (хранится под N OR-60 в лаборатории микробиологии, Технический университет Дельфта, Нидерланды; патент США N Re 30602), была частично переварена рестрикционным ферментом San 3A и лигирована в Bam HI сайт плазмиды рИВ 110 (Gryczan et al., Y. Bacteriol 134, 1978, 313-329). Плазмида ДНК рИВ 110 была приготовлена как описано Birnoboim и Doly (Nucl. Acids Res, 7, 1979, 1513-1523). Лигирующую смесь трансформировали в B. subtilis IA40. Генетический центр хранения бацилл по способу Spizizen et. al., I. Bacteriol 81 (1961) 741-746, используя 0,6-1 мкг ДНК на мл компетентных клеток. Клетки из трансформационной смеси высеивали на минимальные чашки, содержащие 2,8% K2HPO4, 1,2% KH2PO4, 0,4% (NH4)2SO4, 0,2% три-Na-цитрат


Формула изобретения
1. Способ получения сериновой протеазы, предусматривающий трансформацию штамма бацилл рекомбинатной плазмидной ДНК, культивирование трансформантов, выделение и очистку целевого продукта, отличающийся тем, что трансформируют штамм щелочефильных Bacillus, при этом в качестве плазмидной ДНК используют PMAX4. 2. Способ по п.1, отличающийся тем, что трансформацию штамма Bacillus осуществляют путем обработки штамма лизоцимом в щелочной среде при 20 - 37oС, отделения образовавшихся протопластов от лизоцима, объединения протопластов с рекомбинатной плазмидной ДНК при той же температуре в присутствии реагента для смешения, регенерации клеток штаммов и выращивания регенерированных клеток в селективных условиях. 3. Штамм щелочефильных Bacillus PB 92/ pMAX-4 - продуцент сериновой протеазы.РИСУНКИ
Рисунок 1, Рисунок 2, Рисунок 3, Рисунок 4, Рисунок 5, Рисунок 6