Система управления техническими средствами судна для экологического контроля водной среды, содержащая авторулевой, блок управления движением, механический указатель курса, радиолокационную станцию, подключенную к входу видеоиндикатора радиолокационной обстановки, гирокомпас, блок управления главным двигателем, блок выработки сигналов управления техническими средствами, подключенный первым и вторым выходами к входам управления радиолокационной станции и блока управления главными двигателями соответственно, приемоиндикатор спутниковой радионавигационной системы, радиостанцию дальней связи, подключенную входом и выходом соответственно к третьему выходу и к первому входу блока выработки сигналов управления техническими средствами, радиостанцию ближней связи, подключенную соответственно входом и выходом к четвертому выходу и к второму входу блока выработки сигналов управления техническими средствами, при этом первый, второй и третий выходы блока управления движением подключены соответственно к первому, второму и третьему входам авторулевого, отличающаяся тем. что в нее введены система экологического контроля, подводный буксир, устройство забора воды, транслятор курса, задатчик сигналов коррекции, блок сравнения и блок задания плана движения, подключенный выходом к первому входу блока сравнения, второй вход которого соединен с выходом приемоиндикатора спутниковой радионавигационной системы и с первым входом системы экологического контроля, второй вход которой подключен к первому выходу подводного буксира, а ее выход связан с четвертым входом блока выработки сигналов управления техническими средствами, пятый вход которого подключен к выходу блока сравнения, третий вход и пятый выход блока выработки сигналов управления техническими средствами подключен соответственно к второму выходу и к входу подводного буксира, при этом задатчик сигналов коррекции выходом подключен к первому входу блока управления движением, второй вход которого соединен с первым выходом транслятора курса, вход которого подключен к выходу гирокомпаса, а его второй выход соединен с четвертым входом авторулевого и с входом его механического указателя курса, при этом третий вход системы экологического контроля подключен к выходу устройства забора воды.